Changeset 21048 in main


Ignore:
Timestamp:
07/18/20 16:42:05 (6 months ago)
Author:
LoisHaggard_NM
Message:

nmibis-content query/idepi, COVID AA deaths and case fatality, small area

Location:
adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi
Files:
3 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19Cnty.xml

    r21047 r21048  
    123123                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    124124                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
    125                                         <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     125                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Deaths</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
    126126                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    127127                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    … …  
    204204 
    205205                <CONFIGURATION><NAME>CaseFatality</NAME>
    206                         <TITLE>Percentage Distribution of Cases</TITLE>
    207                         <DESCRIPTION>The percentage distribution of cases across dimension values.</DESCRIPTION>
     206                        <TITLE>Case Fatality: Percentage of Cases Resulting in Death</TITLE>
     207                        <DESCRIPTION>The percentage of cases resulting in death.</DESCRIPTION>
    208208                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
    209209                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
    210210                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
    211211                        <MEASURE_NAME>PctDesirableLow</MEASURE_NAME>
    212                         <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Percentage of COVID-19 Cases Resulting in Death</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
     212                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Case Fatality: Percentage of Cases</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
    213213                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
    214214                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    … …  
    220220                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    221221                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
    222                                 </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    223                                 <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    224                                         <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     222                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Deaths</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     223                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     224                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     225                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     226                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
    225227                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    226228                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
    … …  
    258260                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Percentage Distribution of Cases</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
    259261                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
    260         <!--                    <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    261                                         <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
    262                                 </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    263                                 <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    264                                         <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
    265                                 </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    266         -->                     <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    267                                         <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
    268                                 </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    269                                 <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    270                                         <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     262                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     263                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     264                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Cases in Group</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     265                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     266                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     267                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     268                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Total Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
    271269                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    272270                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>

  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19Sarea.xml

    r21043 r21048  
    6666                </CONFIGURATION>
    6767
    68                 <CONFIGURATION><NAME>CrudeRate</NAME>
     68                <CONFIGURATION><NAME>CrudeRateCases</NAME>
    6969                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
    7070                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
    7171                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
    72                         <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelGrBlu</DEFAULT_MAP_NAME>
    73                         <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBar</DEFAULT_CHART_NAME>
     72                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
     73                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
    7474                        <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME>
    7575                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
    7676                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     77                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     78                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     79                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     80                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     81                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     82                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    7783                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
    7884                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
    … …  
    9197                        <CRITERIA>
    9298                                <EXCLUDE>
    93                                         <SELECTIONS>
    94                                                 <SELECTION>
    95                                                 </SELECTION>
    96                                         </SELECTIONS>
    9799                                </EXCLUDE>
    98100                        </CRITERIA>
    … …  
    103105                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
    104106                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
     107                        </DATA_SOURCE_NAMES>
     108                        <DATA_ISSUES>
     109                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
     110                        </DATA_ISSUES>
     111                </CONFIGURATION>
     112
     113                <CONFIGURATION><NAME>CrudeRateDeaths</NAME>
     114                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
     115                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
     116                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
     117                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
     118                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
     119                        <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME>
     120                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     121                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     122                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     123                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     124                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     125                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     126                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     127                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     128                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     129                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Deaths</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     130                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     131                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     132                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     133                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     134                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     135                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     136                        <PARAMETERS>
     137                                <PARAMETER>
     138                                        <NAME>func</NAME>
     139                                        <VALUE>NM_RateCrudeCOVID.def</VALUE>
     140                                </PARAMETER>
     141                                <PARAMETER>
     142                                        <NAME>CaseDisp4</NAME>
     143                                        <VALUE>1</VALUE>
     144                                </PARAMETER>
     145                        </PARAMETERS>
     146                        <CRITERIA>
     147                                <EXCLUDE/>
     148                        </CRITERIA>
     149                        <DATA_NOTES>
     150                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
     151                        </DATA_NOTES>
     152                        <DATA_SOURCE_NAMES>
     153                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
     154                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
     155                        </DATA_SOURCE_NAMES>
     156                        <DATA_ISSUES>
     157                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
     158                        </DATA_ISSUES>
     159                </CONFIGURATION>
     160
     161                <CONFIGURATION><NAME>AgeRateDths</NAME>
     162                        <TITLE>Deaths per 100,000 Population, Age-adjusted</TITLE>
     163                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
     164                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
     165                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
     166                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
     167                        <MEASURE_NAME>RateAADths100K</MEASURE_NAME>
     168                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     169                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     170                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     171                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     172                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     173                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     174                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     175                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     176                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     177                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Deaths</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     178                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     179                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     180                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     181                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     182                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     183                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     184                        <PARAMETERS>
     185                                <PARAMETER>
     186                                        <NAME>func</NAME>
     187                                        <VALUE>NM_RateAADths100K.def</VALUE>
     188                                </PARAMETER>
     189                                <PARAMETER>
     190                                        <NAME>CaseDisp4</NAME>
     191                                        <VALUE>1</VALUE>
     192                                </PARAMETER>
     193                        </PARAMETERS>
     194                        <CRITERIA>
     195                                <EXCLUDE/>
     196                        </CRITERIA>
     197                        <DATA_NOTES>
     198                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
     199                        </DATA_NOTES>
     200                        <DATA_SOURCE_NAMES>
     201                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
     202                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
     203                        </DATA_SOURCE_NAMES>
     204                        <DATA_ISSUES>
     205                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
     206                        </DATA_ISSUES>
     207                </CONFIGURATION>
     208 
     209                <CONFIGURATION><NAME>CaseFatality</NAME>
     210                        <TITLE>Case Fatality: Percentage of Cases Resulting in Death</TITLE>
     211                        <DESCRIPTION>The percentage of cases resulting in death.</DESCRIPTION>
     212                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
     213                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
     214                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
     215                        <MEASURE_NAME>PctDesirableLow</MEASURE_NAME>
     216                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Case Fatality: Percentage of Cases</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
     217                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     218                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     219                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     220                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     221                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     222                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     223                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     224                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     225                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     226                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Deaths</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     227                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     228                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     229                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     230                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     231                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     232                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     233                        <PARAMETERS>
     234                                <PARAMETER>
     235                                        <NAME>func</NAME>
     236                                        <VALUE>NM_CaseFatalityCOVID.def</VALUE>
     237                                </PARAMETER>
     238                                <PARAMETER>
     239                                        <NAME>spvar1</NAME>
     240                                        <VALUE>disp4cat=1</VALUE>
     241                                </PARAMETER>
     242                        </PARAMETERS>
     243                        <CRITERIA>
     244                        </CRITERIA>
     245                        <DATA_NOTES>
     246                                <ibis:include href="data_note/COVID_AA.xml"/>
     247                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
     248                        </DATA_NOTES>
     249                        <DATA_SOURCE_NAMES>
     250                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
    105251                        </DATA_SOURCE_NAMES>
    106252                        <DATA_ISSUES>
    … …  
    118264                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Percentage Distribution of Cases</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
    119265                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
    120         <!--                    <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    121                                         <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
    122                                 </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    123                                 <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    124                                         <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
    125                                 </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    126         -->                     <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    127                                         <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
    128                                 </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    129                                 <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    130                                         <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     266                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     267                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     268                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Cases in Group</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     269                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     270                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     271                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     272                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Total Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
    131273                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    132274                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
    … …  
    141283                        <DATA_NOTES>
    142284                                <ibis:include href="data_note/PctDistribution.xml"/>
    143                                 <ibis:include href="data_note/NoDetention.xml"/>
    144285                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
    145286                        </DATA_NOTES>
    … …  
    178319                <ibis:include href="dimension/CaseDisp4.xml"/>
    179320                <ibis:include href="dimension/ReasonTested.xml"/>
    180                 <ibis:include href="dimension/SpecialPop.xml" configuration-name-list="Count, PctDistribution"/>
     321                <ibis:include href="dimension/LongTermCare.xml"/>
     322                <ibis:include href="dimension/Detention.xml"/>
    181323
    182324                <ibis:include href="dimension/MMWR_WeekCOVID.xml"/>

  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/_COVIDSelection.xml

    r21047 r21048  
    8080                                <SELECTION>
    8181                                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
    82                                         <LOCAL_URL>query/result/idepi/COVID19Sarea/CrudeRate.html</LOCAL_URL>
     82                                        <LOCAL_URL>query/result/idepi/COVID19Sarea/CrudeRateCases.html</LOCAL_URL>
    8383                                </SELECTION>
    8484                                <SELECTION>
    85                                         <TITLE>Cases per 100,000 Population, Age-adjusted</TITLE>
    86                                         <LOCAL_URL>query/result/idepi/COVID19Sarea/AgeRate.html</LOCAL_URL>
     85                                        <TITLE>Deaths per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
     86                                        <LOCAL_URL>query/result/idepi/COVID19Sarea/CrudeRateDeaths.html</LOCAL_URL>
     87                                </SELECTION>
     88                                <SELECTION>
     89                                        <TITLE>Deaths per 100,000 Population, Age-adjusted</TITLE>
     90                                        <LOCAL_URL>query/result/idepi/COVID19Sarea/AgeRateDths.html</LOCAL_URL>
     91                                </SELECTION>
     92                                <SELECTION>
     93                                        <TITLE>Case Fatality Rate, Age-adjusted (Percentage of Cases Resulting in Death)</TITLE>
     94                                        <LOCAL_URL>query/result/idepi/COVID19Sarea/CaseFatality.html</LOCAL_URL>
     95                                </SELECTION>
     96                                <SELECTION>
     97                                        <TITLE>Percentage Distribution by Population and Case Characteristics</TITLE>
     98                                        <LOCAL_URL>query/result/idepi/COVID19Sarea/PctDistribution.html</LOCAL_URL>
    8799                                </SELECTION>
    88100                        </SELECTIONS>
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.