Changeset 21043 in main


Ignore:
Timestamp:
07/17/20 17:42:26 (3 weeks ago)
Author:
LoisHaggard_NM
Message:

nmibis-content query/idepi, COVID deaths and hospitalizations

Location:
adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi
Files:
3 added
6 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19Cnty.xml

    r21016 r21043  
    66        <TITLE>New Mexico COVID-19 Data</TITLE>
    77        <DESCRIPTION>Queries infectious disease data from NMEDSS.</DESCRIPTION>
    8         <VERSION>Jul 10, 2020</VERSION>
     8        <VERSION>Jul 17, 2020</VERSION>
    99        <KEYWORDS>communicable disease, infectious disease, notifiable diseases, epidemiology, New Mexcio</KEYWORDS>
    1010        <ORG_UNIT_NAME>ID_EPI</ORG_UNIT_NAME>
     
    6262                </CONFIGURATION>
    6363
    64                 <CONFIGURATION><NAME>CrudeRate</NAME>
     64                <CONFIGURATION><NAME>CrudeRateCases</NAME>
    6565                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
    6666                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
     
    9393                        <CRITERIA>
    9494                                <EXCLUDE>
    95                                         <SELECTIONS>
    96                                                 <SELECTION>
    97                                                         <NAME>SpecialPop_exclude</NAME>
    98                                                         <VALUE>all</VALUE>
    99                                                 </SELECTION>
    100                                         </SELECTIONS>
    10195                                </EXCLUDE>
    10296                        </CRITERIA>
    10397                        <DATA_NOTES>
    10498                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
    105                                 <ibis:include href="data_note/COVID_AA.xml"/>
    10699                        </DATA_NOTES>
    107100                        <DATA_SOURCE_NAMES>
     
    114107                </CONFIGURATION>
    115108
    116                 <CONFIGURATION><NAME>AgeRate</NAME>
     109                <CONFIGURATION><NAME>CrudeRateDths</NAME>
     110                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
     111                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
     112                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
     113                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
     114                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
     115                        <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME>
     116                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     117                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     118                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     119                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     120                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     121                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     122                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     123                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     124                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     125                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     126                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     127                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     128                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     129                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     130                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     131                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     132                        <PARAMETERS>
     133                                <PARAMETER>
     134                                        <NAME>func</NAME>
     135                                        <VALUE>NM_RateCrudeCOVID.def</VALUE>
     136                                </PARAMETER>
     137                        </PARAMETERS>
     138                        <CRITERIA>
     139                                <EXCLUDE/>
     140                        </CRITERIA>
     141                        <DATA_NOTES>
     142                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
     143                        </DATA_NOTES>
     144                        <DATA_SOURCE_NAMES>
     145                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
     146                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
     147                        </DATA_SOURCE_NAMES>
     148                        <DATA_ISSUES>
     149                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
     150                        </DATA_ISSUES>
     151                </CONFIGURATION>
     152
     153                <CONFIGURATION><NAME>AgeRateDths</NAME>
    117154                        <TITLE>Cases per 100,000 Population, Age-adjusted</TITLE>
    118155                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
     
    120157                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
    121158                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
    122                         <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME> <!--Use this measure so I can have a special data note for covid AA-->
    123                         <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Cases per 100,000 Population, Age-adjusted</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
     159                        <MEASURE_NAME>RateAA100K</MEASURE_NAME>
     160                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Deaths per 100,000 Population, Age-adjusted</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
    124161                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
    125162                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     
    141178                                <PARAMETER>
    142179                                        <NAME>func</NAME>
    143                                         <VALUE>NM_RateAA100KCOVID.def</VALUE>
    144                                 </PARAMETER>
    145                         </PARAMETERS>
    146                         <CRITERIA>
    147                                 <EXCLUDE>
    148                                         <SELECTIONS>
    149                                                 <SELECTION>
    150                                                         <NAME>SpecialPop_exclude</NAME>
    151                                                         <VALUE>all</VALUE>
    152                                                 </SELECTION>
    153                                         </SELECTIONS>
    154                                 </EXCLUDE>
     180                                        <VALUE>NM_RateAA100K.def</VALUE>
     181                                </PARAMETER>
     182                                <PARAMETER>
     183                                        <NAME>CaseDisp4</NAME>
     184                                        <VALUE>1</VALUE>
     185                                </PARAMETER>
     186                        </PARAMETERS>
     187                        <CRITERIA>
     188                                <EXCLUDE/>
     189                        </CRITERIA>
     190                        <DATA_NOTES>
     191                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
     192                        </DATA_NOTES>
     193                        <DATA_SOURCE_NAMES>
     194                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
     195                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
     196                        </DATA_SOURCE_NAMES>
     197                        <DATA_ISSUES>
     198                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
     199                        </DATA_ISSUES>
     200                </CONFIGURATION>
     201 
     202                <CONFIGURATION><NAME>CaseFatality</NAME>
     203                        <TITLE>Percentage Distribution of Cases</TITLE>
     204                        <DESCRIPTION>The percentage distribution of cases across dimension values.</DESCRIPTION>
     205                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
     206                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
     207                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
     208                        <MEASURE_NAME>Percentage</MEASURE_NAME>
     209                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Percentage of COVID-19 Cases Resulting in Death</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
     210                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     211                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     212                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     213                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     214                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     215                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     216                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     217                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     218                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     219                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     220                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     221                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     222                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     223                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     224                        <PARAMETERS>
     225                                <PARAMETER>
     226                                        <NAME>func</NAME>
     227                                        <VALUE>NM_CaseFatalityCOVID.def</VALUE>
     228                                </PARAMETER>
     229                                <PARAMETER>
     230                                        <NAME>spvar1</NAME>
     231                                        <VALUE>disp4cat=1</VALUE>
     232                                </PARAMETER>
     233                        </PARAMETERS>
     234                        <CRITERIA>
    155235                        </CRITERIA>
    156236                        <DATA_NOTES>
     
    160240                        <DATA_SOURCE_NAMES>
    161241                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
    162                                 <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
    163242                        </DATA_SOURCE_NAMES>
    164243                        <DATA_ISSUES>
     
    235314                <ibis:include href="dimension/CaseDisp4.xml"/>
    236315                <ibis:include href="dimension/ReasonTested.xml"/>
    237                 <ibis:include href="dimension/SpecialPop.xml" configuration-name-list="Count, PctDistribution"/>
     316                <ibis:include href="dimension/LongTermCare.xml"/>
     317                <ibis:include href="dimension/Detention.xml"/>
    238318
    239319                <ibis:include href="dimension/MMWR_WeekCOVID.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19Sarea.xml

    r21016 r21043  
    9393                                        <SELECTIONS>
    9494                                                <SELECTION>
    95                                                         <NAME>SpecialPop_exclude</NAME>
    96                                                         <VALUE>all</VALUE>
    9795                                                </SELECTION>
    9896                                        </SELECTIONS>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/_COVIDSelection.xml

    r21016 r21043  
    44
    55        <NAME>COVIDSelection</NAME>
    6         <TITLE>New Mexico Novel Corona Virus Disease Data (data updated daily at 10:00 AM)</TITLE>
     6        <TITLE>New Mexico Novel Corona Virus Disease Data (data updated daily at 12:15 PM)</TITLE>
    77        <DESCRIPTION>Data from NMEDSS system, default graph is epi curve by month.</DESCRIPTION>
    8         <VERSION>Jun 19, 2020</VERSION>
     8        <VERSION>Jul 13, 2020</VERSION>
    99        <ORG_UNIT_NAME>ID_EPI</ORG_UNIT_NAME>
    1010
     
    3030                                </SELECTION>
    3131                                <SELECTION>
    32                                         <TITLE>Cases per 100,000 Population, Age-adjusted</TITLE>
    33                                         <LOCAL_URL>query/result/idepi/COVID19Cnty/AgeRate.html</LOCAL_URL>
     32                                        <TITLE>Deaths per 100,000 Population, Age-adjusted</TITLE>
     33                                        <LOCAL_URL>query/result/idepi/COVID19Cnty/AgeRateDths.html</LOCAL_URL>
     34                                </SELECTION>
     35                                <SELECTION>
     36                                        <TITLE>Case Fatality Rate, Age-adjusted (Percentage of Cases Resulting in Death)</TITLE>
     37                                        <LOCAL_URL>query/result/idepi/COVID19Cnty/CaseFatality.html</LOCAL_URL>
    3438                                </SELECTION>
    3539                                <SELECTION>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/_IDEpiSelection.xml

    r19910 r21043  
    2828                                <SELECTION>
    2929                                        <TITLE>Number of Cases (Count)</TITLE>
    30                                         <LOCAL_URL>query/result/idepi/AllConditions/Count.html</LOCAL_URL>
    31                                 </SELECTION>
    32                                 <SELECTION>
    33                                         <TITLE>Cases per 100,000 Population (Rate)</TITLE>
    34                                         <LOCAL_URL>query/result/idepi/AllConditions/Rate.html</LOCAL_URL>
     30                                        <LOCAL_URL>query/result/idepi/AllConditions/CountAll.html</LOCAL_URL>
     31                                </SELECTION>
     32                                <SELECTION>
     33                                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Rate)</TITLE>
     34                                        <LOCAL_URL>query/result/idepi/AllConditions/RateAll.html</LOCAL_URL>
    3535                                </SELECTION>
    3636                        </SELECTIONS>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/dimension/SpecialPop.xml

    r21015 r21043  
    66        <VALUES>
    77                <VALUE>1<TITLE>Long Term Care Facility Resident</TITLE><SORT_ORDER>1</SORT_ORDER></VALUE>
    8                 <VALUE>2<TITLE>Inmate in Corrections or Detention Center</TITLE><SORT_ORDER>2</SORT_ORDER></VALUE>
    9                 <VALUE>3<TITLE>General Commiunity, No Special Population</TITLE><SORT_ORDER>3</SORT_ORDER></VALUE>
     8                <VALUE>2<TITLE>Inmate in Corrections or Detention Facility</TITLE><SORT_ORDER>2</SORT_ORDER></VALUE>
     9                <VALUE>3<TITLE>General Community, No Special Population</TITLE><SORT_ORDER>3</SORT_ORDER></VALUE>
    1010        </VALUES>
    1111</DIMENSION>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/section/CaseCharCOVID.xml

    r21015 r21043  
    77        <SELECTED_DIMENSIONS>
    88                <SELECTED_DIMENSION>
    9                         <NAME>SpecialPop</NAME>
    10                         <VALUES><VALUE>3</VALUE></VALUES>
     9                        <NAME>Detention</NAME>
     10                        <VALUES><VALUE>2</VALUE></VALUES>
    1111                </SELECTED_DIMENSION>
    1212        </SELECTED_DIMENSIONS>
     
    4646
    4747                <SELECTION>
    48                         <TITLE>Special Populations</TITLE>
    49                         <NAME>SpecialPop_exclude</NAME>
     48                        <TITLE>Long Term Care</TITLE>
     49                        <NAME>LongTermCare_exclude</NAME>
    5050                        <VALUE>all</VALUE>
    5151                        <SELECTIONS>
    5252                                <SELECTION><TITLE>All Cases (default)</TITLE></SELECTION>
    53                                 <DIMENSION_NAME>SpecialPop</DIMENSION_NAME>
     53                                <DIMENSION_NAME>LongTermCare</DIMENSION_NAME>
    5454                                <SELECTION_TYPE>
    5555                                        <LIST>
    56                                                 <SIZE>4</SIZE>
     56                                                <SIZE>3</SIZE>
    5757                                                <MULTIPLE/>
    5858                                        </LIST>
     
    6161                </SELECTION>
    6262
     63                <SELECTION>
     64                        <TITLE>Corrections and Detention Centers</TITLE>
     65                        <NAME>Detention_exclude</NAME>
     66                        <VALUE>all</VALUE>
     67                        <SELECTIONS>
     68                                <DIMENSION_NAME>Detention</DIMENSION_NAME>
     69                                <SELECTION_TYPE>
     70                                        <LIST>
     71                                                <SIZE>3</SIZE>
     72                                                <MULTIPLE/>
     73                                        </LIST>
     74                                </SELECTION_TYPE>
     75                        </SELECTIONS>
     76                </SELECTION>
    6377        </SELECTIONS>
    6478
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.