Changeset 21016 in main


Ignore:
Timestamp:
07/12/20 13:13:08 (5 weeks ago)
Author:
LoisHaggard_NM
Message:

nmibis-content query/idepi updates for age-adjusted deaths

Location:
adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi
Files:
4 added
30 edited
3 moved

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/AllConditions.xml

    r20972 r21016  
    125125                        <ibis:include href="section/CaseStat.xml"/>
    126126                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    127                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     127                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    128128                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    129129                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Botulism.xml

    r20986 r21016  
    162162                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    163163                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    164                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     164                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    165165                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    166166                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19Cnty.xml

    r21015 r21016  
    103103                        <DATA_NOTES>
    104104                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
     105                                <ibis:include href="data_note/COVID_AA.xml"/>
     106                        </DATA_NOTES>
     107                        <DATA_SOURCE_NAMES>
     108                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
     109                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
     110                        </DATA_SOURCE_NAMES>
     111                        <DATA_ISSUES>
     112                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
     113                        </DATA_ISSUES>
     114                </CONFIGURATION>
     115
     116                <CONFIGURATION><NAME>AgeRate</NAME>
     117                        <TITLE>Cases per 100,000 Population, Age-adjusted</TITLE>
     118                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
     119                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
     120                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
     121                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
     122                        <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME> <!--Use this measure so I can have a special data note for covid AA-->
     123                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Cases per 100,000 Population, Age-adjusted</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
     124                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     125                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     126                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     127                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     128                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     129                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     130                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     131                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     132                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     133                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     134                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     135                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     136                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     137                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     138                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     139                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     140                        <PARAMETERS>
     141                                <PARAMETER>
     142                                        <NAME>func</NAME>
     143                                        <VALUE>NM_RateAA100KCOVID.def</VALUE>
     144                                </PARAMETER>
     145                        </PARAMETERS>
     146                        <CRITERIA>
     147                                <EXCLUDE>
     148                                        <SELECTIONS>
     149                                                <SELECTION>
     150                                                        <NAME>SpecialPop_exclude</NAME>
     151                                                        <VALUE>all</VALUE>
     152                                                </SELECTION>
     153                                        </SELECTIONS>
     154                                </EXCLUDE>
     155                        </CRITERIA>
     156                        <DATA_NOTES>
     157                                <ibis:include href="data_note/COVID_AA.xml"/>
     158                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
    105159                        </DATA_NOTES>
    106160                        <DATA_SOURCE_NAMES>
     
    145199                        <DATA_NOTES>
    146200                                <ibis:include href="data_note/PctDistribution.xml"/>
    147                                 <ibis:include href="data_note/NoDetention.xml"/>
    148201                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
    149202                        </DATA_NOTES>
     
    166219                        <ibis:include href="section/CaseCharCOVID.xml"/>
    167220                        <ibis:include href="section/GeoCOVID.xml"/>
    168                         <ibis:include href="section/Period_COVID.xml"/>
    169                         <ibis:include href="section/AgeSexRace.xml"/>
     221                        <ibis:include href="section/PeriodCOVID.xml"/>
     222                        <ibis:include href="section/AgeSexRaceCOVID.xml" configuration-name-list="Count, CrudeRate PctDistribution"/>
     223                        <ibis:include href="section/SexRace.xml" configuration-name-list="AgeRate"/>
    170224                </SECTIONS>
    171225        </CRITERIA>
     
    187241                <ibis:include href="dimension/AgeGrpProxy.xml"/>
    188242                <ibis:include href="dimension/AgeGrp4.xml"/>
     243                <ibis:include href="dimension/AgeGrp5.xml"/>
    189244                <ibis:include href="dimension/AgeGrp7.xml"/>
    190245                <ibis:include href="dimension/AgeGrp8.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19Sarea.xml

    r21015 r21016  
    164164                        <ibis:include href="section/CaseCharCOVID.xml"/>
    165165                        <ibis:include href="section/GeoSarea.xml"/>
    166                         <ibis:include href="section/Period_COVID.xml"/>
    167                         <ibis:include href="section/AgeSexRace.xml"/>
     166                        <ibis:include href="section/PeriodCOVID.xml"/>
     167                        <ibis:include href="section/AgeSexRaceCOVID.xml"/>
    168168                </SECTIONS>
    169169        </CRITERIA>
     
    186186                <ibis:include href="dimension/AgeGrpProxy.xml"/>
    187187                <ibis:include href="dimension/AgeGrp4.xml"/>
     188                <ibis:include href="dimension/AgeGrp5.xml"/>
    188189                <ibis:include href="dimension/AgeGrp7.xml"/>
    189190                <ibis:include href="dimension/AgeGrp8.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Campy.xml

    r20986 r21016  
    127127                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    128128                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    129                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     129                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    130130                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Cocci.xml

    r20985 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Crypto.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Dashboard.xml

    r20972 r21016  
    723723                        <ibis:include configuration-name-list="HepBRate" href="section/HepBAcuteChronic.xml"/>
    724724                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    725                 <!--    <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>  -->
     725                <!--    <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>   -->
    726726                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    727727                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Giardia.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/HepA.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/HepB.xml

    r20986 r21016  
    147147                        <ibis:include href="section/HepBAcuteChronic.xml"/>
    148148                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    149                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     149                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    150150                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    151151                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/HepC_TurnOff20181120.xml

    r20986 r21016  
    202202                        <ibis:include href="section/CaseStat.xml"/>
    203203                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    204                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     204                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    205205                        <ibis:include href="section/AgeGrpLT30.xml"/>
    206206                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Hib.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Legion.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Mening.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Pertussis.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Plague.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Rabies.xml

    r20986 r21016  
    146146                        <ibis:include href="section/CaseStat.xml"/>
    147147                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    148                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     148                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    149149                </SECTIONS>
    150150        </CRITERIA>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/STEC.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Salmonella.xml

    r20986 r21016  
    146146                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    147147                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    148                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     148                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    149149                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    150150                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Shigella.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/StrepAInv.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/StrepBInv.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/StrepPneumo.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/TB.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Tetanus.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Tularemia.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/Varicella.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/WestNile.xml

    r20986 r21016  
    130130                        <ibis:include href="section/CaseStatus.xml"/>
    131131                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    132                         <ibis:include href="section/Period_MMWR.xml"/>
     132                        <ibis:include href="section/PeriodMMWR.xml"/>
    133133                        <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    134134                        <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/_COVIDSelection.xml

    r21009 r21016  
    2828                                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
    2929                                        <LOCAL_URL>query/result/idepi/COVID19Cnty/CrudeRate.html</LOCAL_URL>
     30                                </SELECTION>
     31                                <SELECTION>
     32                                        <TITLE>Cases per 100,000 Population, Age-adjusted</TITLE>
     33                                        <LOCAL_URL>query/result/idepi/COVID19Cnty/AgeRate.html</LOCAL_URL>
    3034                                </SELECTION>
    3135                                <SELECTION>
     
    7074                                        <LOCAL_URL>query/result/idepi/COVID19Sarea/CrudeRate.html</LOCAL_URL>
    7175                                </SELECTION>
     76                                <SELECTION>
     77                                        <TITLE>Cases per 100,000 Population, Age-adjusted</TITLE>
     78                                        <LOCAL_URL>query/result/idepi/COVID19Sarea/AgeRate.html</LOCAL_URL>
     79                                </SELECTION>
    7280                        </SELECTIONS>
    7381                </SECTION>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/section/PeriodCOVID.xml

    r21015 r21016  
    22
    33<SECTION xmlns:ibis="http://www.ibisph.org">
    4         <NAME>Period</NAME>
     4        <NAME>PeriodCOVID</NAME>
    55        <TITLE>TIME PERIOD: Select MMWR Week</TITLE>
    66
     
    1212                        </VALUES>
    1313                </SELECTED_DIMENSION>
    14         </SELECTED_DIMENSIONS>-->
     14        </SELECTED_DIMENSIONS>
     15-->
    1516        <SELECTIONS>
    1617                <TITLE>Select MMWR Week(s). (To display by MMWR week, select it in last step, below.)</TITLE>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/section/PeriodCOVIDTests.xml

    r21015 r21016  
    22
    33<SECTION xmlns:ibis="http://www.ibisph.org">
     4
     5        <NAME>PeriodCOVIDTests</NAME>
     6        <TITLE>PERIOD: Select time period</TITLE>
    47
    58<!--    <SELECTED_DIMENSIONS>
     
    1013        </SELECTED_DIMENSIONS>
    1114-->
    12         <NAME>Period_COVIDTests</NAME>
    13         <TITLE>PERIOD: Select time period</TITLE>
    1415        <SELECTIONS>
    1516                <TITLE>Select a time period to filter records.</TITLE>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/section/PeriodMMWR.xml

    r21015 r21016  
    22
    33<SECTION xmlns:ibis="http://www.ibisph.org">
    4         <NAME>Period</NAME>
     4        <NAME>PeriodMMWR</NAME>
    55        <TITLE>TIME PERIOD: Select Time Period</TITLE>
    66       
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.