Changeset 21015 in main


Ignore:
Timestamp:
07/11/20 18:03:44 (3 weeks ago)
Author:
LoisHaggard_NM
Message:

nmibis-content query/idepi updates for new variables, outcome, reason tested, special populations

Location:
adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi
Files:
3 added
3 deleted
8 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19Cnty.xml

    r21009 r21015  
    5151                        </CRITERIA>
    5252                        <DATA_NOTES>
    53                                 <ibis:include href="data_note/NoDetention.xml"/>
    5453                                <ibis:include href="data_note/COVID.xml"/>
    5554                        </DATA_NOTES>
     
    7170                        <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME>
    7271                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
    73         <!--                    <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     72                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    7473                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
    7574                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     
    7776                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
    7877                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    79         -->                     <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     78                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    8079                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
    8180                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
     
    9392                        </PARAMETERS>
    9493                        <CRITERIA>
     94                                <EXCLUDE>
     95                                        <SELECTIONS>
     96                                                <SELECTION>
     97                                                        <NAME>SpecialPop_exclude</NAME>
     98                                                        <VALUE>all</VALUE>
     99                                                </SELECTION>
     100                                        </SELECTIONS>
     101                                </EXCLUDE>
    95102                        </CRITERIA>
    96103                        <DATA_NOTES>
    97                                 <ibis:include href="data_note/NoDetention.xml"/>
    98104                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
    99105                        </DATA_NOTES>
     
    108114
    109115                <CONFIGURATION><NAME>PctDistribution</NAME>
    110                         <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
    111                         <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
     116                        <TITLE>Percentage Distribution of Cases</TITLE>
     117                        <DESCRIPTION>The percentage distribution of cases across dimension values.</DESCRIPTION>
    112118                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
    113119                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
    114120                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
    115121                        <MEASURE_NAME>Percentage</MEASURE_NAME>
    116                         <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Percentage Distribution</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
     122                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Percentage Distribution of Cases</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
    117123                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
    118124        <!--                    <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     
    124130        -->                     <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    125131                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
    126                                         <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Cases by Category</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
    127132                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    128133                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    129134                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
    130                                         <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Total Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
    131135                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
    132136                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     
    140144                        </CRITERIA>
    141145                        <DATA_NOTES>
     146                                <ibis:include href="data_note/PctDistribution.xml"/>
    142147                                <ibis:include href="data_note/NoDetention.xml"/>
    143148                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
     
    160165                <SECTIONS>
    161166                        <ibis:include href="section/CaseCharCOVID.xml"/>
    162                         <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
     167                        <ibis:include href="section/GeoCOVID.xml"/>
    163168                        <ibis:include href="section/Period_COVID.xml"/>
    164                         <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    165                         <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
    166                         <ibis:include href="section/RacEth.xml"/>
     169                        <ibis:include href="section/AgeSexRace.xml"/>
    167170                </SECTIONS>
    168171        </CRITERIA>
     
    176179                <ibis:include href="dimension/GeoSarea.xml"/>
    177180
    178                 <ibis:include href="dimension/CaseStatus.xml"/>
    179181                <ibis:include href="dimension/CaseDisp4.xml"/>
    180182                <ibis:include href="dimension/ReasonTested.xml"/>
     183                <ibis:include href="dimension/SpecialPop.xml" configuration-name-list="Count, PctDistribution"/>
    181184
    182185                <ibis:include href="dimension/MMWR_WeekCOVID.xml"/>
     
    184187                <ibis:include href="dimension/AgeGrpProxy.xml"/>
    185188                <ibis:include href="dimension/AgeGrp4.xml"/>
     189                <ibis:include href="dimension/AgeGrp7.xml"/>
    186190                <ibis:include href="dimension/AgeGrp8.xml"/>
    187191                <ibis:include href="dimension/AgeGrp9.xml"/>
    188192                <ibis:include href="dimension/AgeGrp11.xml"/>
     193                <ibis:include href="dimension/AgeGrp13.xml"/>
    189194                <ibis:include href="dimension/AgeGrp18.xml"/>
    190195                <ibis:include href="dimension/AgeGrp35.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19CntyTests.xml

    r20982 r21015  
    359359                <SECTIONS>
    360360                        <ibis:include href="section/TestResult.xml" configuration-name-list="Count TestedRate"/>
    361                         <ibis:include href="section/Period_COVIDTests.xml" configuration-name-list="Count TestedRate PctPositive"/>
    362361                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
    363362                </SECTIONS>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19Sarea.xml

    r20972 r21015  
    5555                        </CRITERIA>
    5656                        <DATA_NOTES>
    57                                 <ibis:include href="data_note/NoDetention.xml"/>
    5857                                <ibis:include href="data_note/COVID.xml"/>
    5958                        </DATA_NOTES>
     
    6766                </CONFIGURATION>
    6867
    69                 <CONFIGURATION><NAME>CountOnsetDate</NAME>
    70                         <TITLE>Number of Cases</TITLE>
    71                         <DESCRIPTION>Number of cases</DESCRIPTION>
    72                         <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
    73                         <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
    74                         <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
    75                         <MEASURE_NAME>NumCases</MEASURE_NAME>
    76                         <PARAMETERS>
    77                                 <PARAMETER>
    78                                         <NAME>func</NAME>
    79                                         <VALUE>NM_CountOnsetDate.def</VALUE>
    80                                 </PARAMETER>
    81                         </PARAMETERS>
    82                         <CRITERIA>
    83                         </CRITERIA>
    84                         <DATA_NOTES>
    85                                 <ibis:include href="data_note/NoDetention.xml"/>
    86                                 <ibis:include href="data_note/COVID.xml"/>
    87                         </DATA_NOTES>
    88                         <DATA_SOURCE_NAMES>
    89                                 <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
    90                                 <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
    91                         </DATA_SOURCE_NAMES>
    92                         <DATA_ISSUES>
    93                                 <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
    94                         </DATA_ISSUES>
    95                 </CONFIGURATION>
    96 
    9768                <CONFIGURATION><NAME>CrudeRate</NAME>
    9869                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
     
    11990                        </PARAMETERS>
    12091                        <CRITERIA>
     92                                <EXCLUDE>
     93                                        <SELECTIONS>
     94                                                <SELECTION>
     95                                                        <NAME>SpecialPop_exclude</NAME>
     96                                                        <VALUE>all</VALUE>
     97                                                </SELECTION>
     98                                        </SELECTIONS>
     99                                </EXCLUDE>
    121100                        </CRITERIA>
    122101                        <DATA_NOTES>
    123                                 <ibis:include href="data_note/NoDetention.xml"/>
    124102                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
    125103                        </DATA_NOTES>
     
    133111                </CONFIGURATION>
    134112
     113                <CONFIGURATION><NAME>PctDistribution</NAME>
     114                        <TITLE>Percentage Distribution of Cases</TITLE>
     115                        <DESCRIPTION>The percentage distribution of cases across dimension values.</DESCRIPTION>
     116                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
     117                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
     118                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
     119                        <MEASURE_NAME>Percentage</MEASURE_NAME>
     120                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Percentage Distribution of Cases</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
     121                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     122        <!--                    <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     123                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     124                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     125                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     126                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     127                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     128        -->                     <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     129                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     130                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     131                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     132                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
     133                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
     134                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
     135                        <PARAMETERS>
     136                                <PARAMETER>
     137                                        <NAME>func</NAME>
     138                                        <VALUE>NM_PctDistribution.def</VALUE>
     139                                </PARAMETER>
     140                        </PARAMETERS>
     141                        <CRITERIA>
     142                        </CRITERIA>
     143                        <DATA_NOTES>
     144                                <ibis:include href="data_note/PctDistribution.xml"/>
     145                                <ibis:include href="data_note/NoDetention.xml"/>
     146                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
     147                        </DATA_NOTES>
     148                        <DATA_SOURCE_NAMES>
     149                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
     150                        </DATA_SOURCE_NAMES>
     151                        <DATA_ISSUES>
     152                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
     153                        </DATA_ISSUES>
     154                </CONFIGURATION>
     155
    135156        </CONFIGURATIONS>
    136157
     
    141162                </OVERVIEWS>
    142163                <SECTIONS>
    143                         <ibis:include href="section/CaseStat.xml"/>
     164                        <ibis:include href="section/CaseCharCOVID.xml"/>
    144165                        <ibis:include href="section/GeoSarea.xml"/>
    145166                        <ibis:include href="section/Period_COVID.xml"/>
    146                         <ibis:include href="section/AgeGrp.xml"/>
    147                         <ibis:include href="section/Sex.xml"/>
    148                         <ibis:include href="section/RacEth.xml"/>
     167                        <ibis:include href="section/AgeSexRace.xml"/>
    149168                </SECTIONS>
    150169        </CRITERIA>
     
    159178                <ibis:include href="dimension/GeoSarea.xml"/>
    160179
    161                 <ibis:include href="dimension/CaseStatus.xml"/>
    162                 <ibis:include href="dimension/CaseDisp3.xml"/>
    163         <!--    <ibis:include href="dimension/DthIndicator.xml"/> -->
    164 
    165                 <ibis:include href="dimension/MMWR_Week.xml"/>
    166         <!--    <ibis:include href="dimension/OnsetDate.xml"/> -->
     180                <ibis:include href="dimension/CaseDisp4.xml"/>
     181                <ibis:include href="dimension/ReasonTested.xml"/>
     182                <ibis:include href="dimension/SpecialPop.xml" configuration-name-list="Count, PctDistribution"/>
     183
     184                <ibis:include href="dimension/MMWR_WeekCOVID.xml"/>
    167185
    168186                <ibis:include href="dimension/AgeGrpProxy.xml"/>
    169187                <ibis:include href="dimension/AgeGrp4.xml"/>
     188                <ibis:include href="dimension/AgeGrp7.xml"/>
    170189                <ibis:include href="dimension/AgeGrp8.xml"/>
    171190                <ibis:include href="dimension/AgeGrp9.xml"/>
    172191                <ibis:include href="dimension/AgeGrp11.xml"/>
     192                <ibis:include href="dimension/AgeGrp13.xml"/>
    173193                <ibis:include href="dimension/AgeGrp18.xml"/>
    174194                <ibis:include href="dimension/AgeGrp35.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19ZIPTests.xml

    r20982 r21015  
    358358                <SECTIONS>
    359359                        <ibis:include href="section/TestResult.xml" configuration-name-list="Count TestedRate"/>
    360                         <ibis:include href="section/Period_COVIDTests.xml" configuration-name-list="Count TestedRate PctPositive"/>
    361360                        <ibis:include href="section/GeoZIP.xml"/>
    362361                </SECTIONS>
     
    366365
    367366                <ibis:include href="dimension/TestResult.xml"/>
    368                 <ibis:include href="dimension/LastWeek.xml"/>
     367                <ibis:include href="dimension/MMWR_WeekCOVID.xml"/>
    369368
    370369                <ibis:include href="dimension/GeoProxy.xml"/>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/dimension/GeoCnty.xml

    r20883 r21015  
    4141                <VALUE>61<TITLE>Valencia</TITLE><SORT_ORDER>61</SORT_ORDER></VALUE>
    4242                <VALUE>97<TITLE>NM, county unkn</TITLE><SORT_ORDER>97</SORT_ORDER></VALUE>
    43         <!--    <VALUE>98<TITLE>Outside New Mexico</TITLE><SORT_ORDER>98</SORT_ORDER></VALUE>-->
    44                 <VALUE>99<TITLE>State of residence and county unknown</TITLE><SORT_ORDER>99</SORT_ORDER></VALUE>
     43        <!--    <VALUE>98<TITLE>Outside New Mexico</TITLE><SORT_ORDER>98</SORT_ORDER></VALUE>
     44                <VALUE>99<TITLE>Residence unknown</TITLE><SORT_ORDER>99</SORT_ORDER></VALUE>-->
    4545       
    4646        </VALUES>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/section/Geo.xml

    r20935 r21015  
    4444                                <SELECTION_TYPE>
    4545                                        <LIST>
    46                                                 <SIZE>6</SIZE>
     46                                                <SIZE>8</SIZE>
    4747                                                <MULTIPLE/>
    4848                                        </LIST>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/section/GeoCOVID.xml

    r20936 r21015  
    4444                                <SELECTION_TYPE>
    4545                                        <LIST>
    46                                                 <SIZE>6</SIZE>
     46                                                <SIZE>8</SIZE>
    4747                                                <MULTIPLE/>
    4848                                        </LIST>
  • adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/section/Period_COVID.xml

    r20984 r21015  
    2121                <SELECTION_TYPE>
    2222                        <LIST>
    23                                 <SIZE>12</SIZE>
     23                                <SIZE>22</SIZE>
    2424                                <MULTIPLE/>
    2525                        </LIST>
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.