source: main/adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19Sarea.xml @ 21048

Last change on this file since 21048 was 21048, checked in by LoisHaggard_NM, 2 months ago

nmibis-content query/idepi, COVID AA deaths and case fatality, small area

File size: 12.1 KB
Line 
1<?xml version="1.0" encoding="ISO-8859-1"?>
2
3<QUERY_MODULE xmlns:ibis="http://www.ibisph.org">
4
5        <NAME>COVID19</NAME>
6        <TITLE>New Mexico COVID-19 Data</TITLE>
7        <DESCRIPTION>Queries infectious disease data from NMEDSS.</DESCRIPTION>
8        <VERSION>Apr 5, 2020</VERSION>
9        <KEYWORDS>communicable disease, infectious disease, notifiable diseases, epidemiology, New Mexcio</KEYWORDS>
10        <ORG_UNIT_NAME>ID_EPI</ORG_UNIT_NAME>
11
12        <PARAMETERS>
13                <PARAMETER>
14                        <NAME>config</NAME>
15                        <VALUE>E:\ibisq\qModules30\idepi\_COVID19Sarea.cfg</VALUE>
16                </PARAMETER>
17                <PARAMETER>
18                        <NAME>sas</NAME>
19                        <VALUE>0</VALUE>
20                </PARAMETER>
21                <PARAMETER>
22                        <NAME>state</NAME>
23                        <VALUE>NM</VALUE>
24                </PARAMETER>
25                <PARAMETER>
26                        <NAME>test</NAME>
27                        <VALUE>0</VALUE>
28                </PARAMETER>
29        </PARAMETERS>
30
31        <QUERY_CONFIGURATION_SELECTION>
32                <LOCAL_URL>query/selection/idepi/_COVIDSelection.html</LOCAL_URL>
33                <TITLE>Infectious Disease Measures</TITLE>
34        </QUERY_CONFIGURATION_SELECTION>
35
36        <QUERY_APPLICATION_REQUEST_ADD_NON_FILTERED_GROUP_BY_DIMENSION_VALUES_FLAG/>
37        <QUERY_APPLICATION_HTTP_REQUEST_TYPE>post</QUERY_APPLICATION_HTTP_REQUEST_TYPE>
38
39        <CONFIGURATIONS>
40
41                <CONFIGURATION><NAME>Count</NAME>
42                        <TITLE>Number of Cases</TITLE>
43                        <DESCRIPTION>Number of cases</DESCRIPTION>
44                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
45                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
46                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
47                        <MEASURE_NAME>NumCases</MEASURE_NAME>
48                        <PARAMETERS>
49                                <PARAMETER>
50                                        <NAME>func</NAME>
51                                        <VALUE>NM_CountCOVID.def</VALUE>
52                                </PARAMETER>
53                        </PARAMETERS>
54                        <CRITERIA>
55                        </CRITERIA>
56                        <DATA_NOTES>
57                                <ibis:include href="data_note/COVID.xml"/>
58                        </DATA_NOTES>
59                        <DATA_SOURCE_NAMES>
60                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
61                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
62                        </DATA_SOURCE_NAMES>
63                        <DATA_ISSUES>
64                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
65                        </DATA_ISSUES>
66                </CONFIGURATION>
67
68                <CONFIGURATION><NAME>CrudeRateCases</NAME>
69                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
70                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
71                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
72                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
73                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
74                        <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME>
75                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
76                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
77                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
78                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
79                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
80                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
81                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
82                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
83                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
84                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
85                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
86                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
87                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
88                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
89                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
90                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
91                        <PARAMETERS>
92                                <PARAMETER>
93                                        <NAME>func</NAME>
94                                        <VALUE>NM_RateCrudeCOVID.def</VALUE>
95                                </PARAMETER>
96                        </PARAMETERS>
97                        <CRITERIA>
98                                <EXCLUDE>
99                                </EXCLUDE>
100                        </CRITERIA>
101                        <DATA_NOTES>
102                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
103                        </DATA_NOTES>
104                        <DATA_SOURCE_NAMES>
105                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
106                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
107                        </DATA_SOURCE_NAMES>
108                        <DATA_ISSUES>
109                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
110                        </DATA_ISSUES>
111                </CONFIGURATION>
112
113                <CONFIGURATION><NAME>CrudeRateDeaths</NAME>
114                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
115                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
116                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
117                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
118                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
119                        <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME>
120                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
121                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
122                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
123                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
124                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
125                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
126                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
127                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
128                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
129                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Deaths</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
130                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
131                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
132                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
133                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
134                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
135                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
136                        <PARAMETERS>
137                                <PARAMETER>
138                                        <NAME>func</NAME>
139                                        <VALUE>NM_RateCrudeCOVID.def</VALUE>
140                                </PARAMETER>
141                                <PARAMETER>
142                                        <NAME>CaseDisp4</NAME>
143                                        <VALUE>1</VALUE>
144                                </PARAMETER>
145                        </PARAMETERS>
146                        <CRITERIA>
147                                <EXCLUDE/>
148                        </CRITERIA>
149                        <DATA_NOTES>
150                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
151                        </DATA_NOTES>
152                        <DATA_SOURCE_NAMES>
153                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
154                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
155                        </DATA_SOURCE_NAMES>
156                        <DATA_ISSUES>
157                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
158                        </DATA_ISSUES>
159                </CONFIGURATION>
160
161                <CONFIGURATION><NAME>AgeRateDths</NAME>
162                        <TITLE>Deaths per 100,000 Population, Age-adjusted</TITLE>
163                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
164                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
165                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
166                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
167                        <MEASURE_NAME>RateAADths100K</MEASURE_NAME>
168                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
169                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
170                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
171                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
172                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
173                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
174                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
175                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
176                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
177                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Deaths</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
178                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
179                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
180                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
181                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
182                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
183                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
184                        <PARAMETERS>
185                                <PARAMETER>
186                                        <NAME>func</NAME>
187                                        <VALUE>NM_RateAADths100K.def</VALUE>
188                                </PARAMETER>
189                                <PARAMETER>
190                                        <NAME>CaseDisp4</NAME>
191                                        <VALUE>1</VALUE>
192                                </PARAMETER>
193                        </PARAMETERS>
194                        <CRITERIA>
195                                <EXCLUDE/>
196                        </CRITERIA>
197                        <DATA_NOTES>
198                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
199                        </DATA_NOTES>
200                        <DATA_SOURCE_NAMES>
201                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
202                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
203                        </DATA_SOURCE_NAMES>
204                        <DATA_ISSUES>
205                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
206                        </DATA_ISSUES>
207                </CONFIGURATION>
208 
209                <CONFIGURATION><NAME>CaseFatality</NAME>
210                        <TITLE>Case Fatality: Percentage of Cases Resulting in Death</TITLE>
211                        <DESCRIPTION>The percentage of cases resulting in death.</DESCRIPTION>
212                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
213                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
214                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
215                        <MEASURE_NAME>PctDesirableLow</MEASURE_NAME>
216                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Case Fatality: Percentage of Cases</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
217                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
218                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
219                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
220                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
221                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
222                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
223                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
224                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
225                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
226                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Deaths</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
227                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
228                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
229                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
230                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
231                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
232                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
233                        <PARAMETERS>
234                                <PARAMETER>
235                                        <NAME>func</NAME>
236                                        <VALUE>NM_CaseFatalityCOVID.def</VALUE>
237                                </PARAMETER>
238                                <PARAMETER>
239                                        <NAME>spvar1</NAME>
240                                        <VALUE>disp4cat=1</VALUE>
241                                </PARAMETER>
242                        </PARAMETERS>
243                        <CRITERIA>
244                        </CRITERIA>
245                        <DATA_NOTES>
246                                <ibis:include href="data_note/COVID_AA.xml"/>
247                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
248                        </DATA_NOTES>
249                        <DATA_SOURCE_NAMES>
250                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
251                        </DATA_SOURCE_NAMES>
252                        <DATA_ISSUES>
253                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
254                        </DATA_ISSUES>
255                </CONFIGURATION>
256
257                <CONFIGURATION><NAME>PctDistribution</NAME>
258                        <TITLE>Percentage Distribution of Cases</TITLE>
259                        <DESCRIPTION>The percentage distribution of cases across dimension values.</DESCRIPTION>
260                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
261                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
262                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
263                        <MEASURE_NAME>Percentage</MEASURE_NAME>
264                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Percentage Distribution of Cases</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
265                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
266                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
267                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
268                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Cases in Group</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
269                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
270                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
271                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
272                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Total Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
273                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
274                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
275                        <PARAMETERS>
276                                <PARAMETER>
277                                        <NAME>func</NAME>
278                                        <VALUE>NM_PctDistribution.def</VALUE>
279                                </PARAMETER>
280                        </PARAMETERS>
281                        <CRITERIA>
282                        </CRITERIA>
283                        <DATA_NOTES>
284                                <ibis:include href="data_note/PctDistribution.xml"/>
285                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
286                        </DATA_NOTES>
287                        <DATA_SOURCE_NAMES>
288                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
289                        </DATA_SOURCE_NAMES>
290                        <DATA_ISSUES>
291                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
292                        </DATA_ISSUES>
293                </CONFIGURATION>
294
295        </CONFIGURATIONS>
296
297        <CRITERIA>
298                <OVERVIEWS>
299                        <ibis:include href="overview/NMEDSS.xml"/>
300                        <ibis:include href="overview/GettingStarted.xml"/>
301                </OVERVIEWS>
302                <SECTIONS>
303                        <ibis:include href="section/CaseCharCOVID.xml"/>
304                        <ibis:include href="section/GeoSarea.xml"/>
305                        <ibis:include href="section/PeriodCOVID.xml"/>
306                        <ibis:include href="section/AgeSexRaceCOVID.xml"/>
307                </SECTIONS>
308        </CRITERIA>
309
310        <DIMENSIONS>
311
312                <ibis:include href="dimension/GeoProxy.xml"/>
313                <ibis:include href="dimension/GeoCnty.xml"/>
314                <ibis:include href="dimension/GeoState.xml"/>
315                <ibis:include href="dimension/GeoRegion.xml"/>
316                <ibis:include href="dimension/GeoUrbanRur.xml"/>
317                <ibis:include href="dimension/GeoSarea.xml"/>
318
319                <ibis:include href="dimension/CaseDisp4.xml"/>
320                <ibis:include href="dimension/ReasonTested.xml"/>
321                <ibis:include href="dimension/LongTermCare.xml"/>
322                <ibis:include href="dimension/Detention.xml"/>
323
324                <ibis:include href="dimension/MMWR_WeekCOVID.xml"/>
325
326                <ibis:include href="dimension/AgeGrpProxy.xml"/>
327                <ibis:include href="dimension/AgeGrp4.xml"/>
328                <ibis:include href="dimension/AgeGrp5.xml"/>
329                <ibis:include href="dimension/AgeGrp7.xml"/>
330                <ibis:include href="dimension/AgeGrp8.xml"/>
331                <ibis:include href="dimension/AgeGrp9.xml"/>
332                <ibis:include href="dimension/AgeGrp11.xml"/>
333                <ibis:include href="dimension/AgeGrp13.xml"/>
334                <ibis:include href="dimension/AgeGrp18.xml"/>
335                <ibis:include href="dimension/AgeGrp35.xml"/>
336
337                <ibis:include href="dimension/Sex.xml"/>
338                <ibis:include href="dimension/RacEth.xml"/>
339
340        </DIMENSIONS>
341
342
343</QUERY_MODULE>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.