source: main/adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19CntyTests.xml @ 20877

Last change on this file since 20877 was 20877, checked in by LoisHaggard_NM, 6 weeks ago

nm backend qModules 3.0 idepi covid positive test percentages

File size: 6.4 KB
Line 
1<?xml version="1.0" encoding="ISO-8859-1"?>
2
3<QUERY_MODULE xmlns:ibis="http://www.ibisph.org">
4
5        <NAME>COVID19</NAME>
6        <TITLE>New Mexico COVID-19 Data</TITLE>
7        <DESCRIPTION>Queries infectious disease data from NMEDSS.</DESCRIPTION>
8        <VERSION>Apr 5, 2020</VERSION>
9        <KEYWORDS>communicable disease, infectious disease, notifiable diseases, epidemiology, New Mexcio</KEYWORDS>
10        <ORG_UNIT_NAME>ID_EPI</ORG_UNIT_NAME>
11
12        <PARAMETERS>
13                <PARAMETER>
14                        <NAME>config</NAME>
15                        <VALUE>E:\ibisq\qModules30\idepi\_COVID19CntyTests.cfg</VALUE>
16                </PARAMETER>
17                <PARAMETER>
18                        <NAME>sas</NAME>
19                        <VALUE>0</VALUE>
20                </PARAMETER>
21                <PARAMETER>
22                        <NAME>test</NAME>
23                        <VALUE>0</VALUE>
24                </PARAMETER>
25        </PARAMETERS>
26
27        <QUERY_CONFIGURATION_SELECTION>
28                <LOCAL_URL>query/selection/idepi/_COVIDSelection.html</LOCAL_URL>
29                <TITLE>Infectious Disease Measures</TITLE>
30        </QUERY_CONFIGURATION_SELECTION>
31
32        <QUERY_APPLICATION_REQUEST_ADD_NON_FILTERED_GROUP_BY_DIMENSION_VALUES_FLAG/>
33        <QUERY_APPLICATION_HTTP_REQUEST_TYPE>post</QUERY_APPLICATION_HTTP_REQUEST_TYPE>
34
35        <CONFIGURATIONS>
36
37                <CONFIGURATION><NAME>Count</NAME>
38                        <TITLE>Number of Tests Conducted</TITLE>
39                        <DESCRIPTION>Number of tests</DESCRIPTION>
40                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
41                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
42                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
43                        <MEASURE_NAME>NumCases</MEASURE_NAME>
44                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Number of Tests</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
45                        <PARAMETERS>
46                                <PARAMETER>
47                                        <NAME>func</NAME>
48                                        <VALUE>NM_CountCOVID.def</VALUE>
49                                </PARAMETER>
50                        </PARAMETERS>
51                        <CRITERIA>
52                        </CRITERIA>
53                        <DATA_NOTES>
54                                <ibis:include href="data_note/COVID.xml"/>
55                        </DATA_NOTES>
56                        <DATA_SOURCES>
57                                <ibis:include href="data_source/NMEDSS.xml"/>
58                                <ibis:include href="data_source/GPS.xml"/>
59                        </DATA_SOURCES>
60                        <DATA_ISSUES>
61                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
62                        </DATA_ISSUES>
63                </CONFIGURATION>
64
65                <CONFIGURATION><NAME>PctPositive</NAME>
66                        <TITLE>Percentage of Tests that were Positive</TITLE>
67                        <DESCRIPTION>Number of cases</DESCRIPTION>
68                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
69                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelBluPur</DEFAULT_MAP_NAME>
70                        <MEASURE_NAME>PctDesirableLow</MEASURE_NAME>
71                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Test Positivity</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
72                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
73                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
74                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
75                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
76                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
77                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
78                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
79                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
80                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
81                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Number of Positive Tests</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
82                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
83                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
84                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
85                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Number of Positive and Negative Tests</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
86                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
87                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
88                        <PARAMETERS>
89                                <PARAMETER>
90                                        <NAME>func</NAME>
91                                        <VALUE>NM_PctDesirableLow.def</VALUE>
92                                </PARAMETER>
93                                <PARAMETER>
94                                        <NAME>spvar1</NAME>
95                                        <VALUE>_RESULT=1</VALUE>
96                                </PARAMETER>
97                                <PARAMETER>
98                                        <NAME>data_where</NAME>
99                                        <VALUE>detention=2</VALUE>
100                                </PARAMETER>
101                                <PARAMETER>
102                                        <NAME>TestResult</NAME>
103                                        <VALUE>1</VALUE>
104                                </PARAMETER>
105                                <PARAMETER>
106                                        <NAME>TestResult</NAME>
107                                        <VALUE>2</VALUE>
108                                </PARAMETER>
109                        </PARAMETERS>
110                        <CRITERIA>
111                        </CRITERIA>
112                        <DATA_NOTES>
113                                <ibis:include href="data_note/COVID.xml"/>
114                        </DATA_NOTES>
115                        <DATA_SOURCE_NAMES>
116                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
117                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
118                        </DATA_SOURCE_NAMES>
119                        <DATA_ISSUES>
120                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
121                        </DATA_ISSUES>
122                </CONFIGURATION>
123
124                <CONFIGURATION><NAME>TestedRate</NAME>
125                        <TITLE>Tests Conducted per 1,000 Population</TITLE>
126                        <DESCRIPTION>The number of tests * 1,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
127                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
128                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
129                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
130                        <MEASURE_NAME>Rate1K</MEASURE_NAME>
131                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Tests per 1,000 Population</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
132                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
133                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
134                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
135                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Tests Conducted</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
136                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
137                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
138                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
139                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
140                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
141                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
142                        <PARAMETERS>
143                                <PARAMETER>
144                                        <NAME>func</NAME>
145                                        <VALUE>NM_Rate1K.def</VALUE>
146                                </PARAMETER>
147                                <PARAMETER>
148                                        <NAME>data_where</NAME>
149                                        <VALUE>detention=2</VALUE>
150                                </PARAMETER>
151                        </PARAMETERS>
152                        <CRITERIA>
153                        </CRITERIA>
154                        <DATA_NOTES>
155                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
156                        </DATA_NOTES>
157                        <DATA_SOURCE_NAMES>
158                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
159                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
160                        </DATA_SOURCE_NAMES>
161                        <DATA_ISSUES>
162                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
163                        </DATA_ISSUES>
164                </CONFIGURATION>
165
166        </CONFIGURATIONS>
167
168        <CRITERIA>
169                <OVERVIEWS>
170                        <ibis:include href="overview/NMEDSS.xml"/>
171                        <ibis:include href="overview/GettingStarted.xml"/>
172                </OVERVIEWS>
173                <SECTIONS>
174                        <ibis:include href="section/TestResult.xml" configuration-name-list="Count TestedRate"/>
175                        <ibis:include href="section/Period_COVIDTests.xml" configuration-name-list="Count TestedRate PctPositive"/>
176                        <ibis:include href="section/Geo.xml"/>
177                </SECTIONS>
178        </CRITERIA>
179
180        <DIMENSIONS>
181
182                <ibis:include href="dimension/TestResult.xml"/>
183                <ibis:include href="dimension/LastWeek.xml"/>
184
185                <ibis:include href="dimension/GeoProxy.xml"/>
186                <ibis:include href="dimension/GeoCnty.xml"/>
187                <ibis:include href="dimension/GeoState.xml"/>
188                <ibis:include href="dimension/GeoRegion.xml"/>
189                <ibis:include href="dimension/GeoUrbanRur.xml"/>
190                <ibis:include href="dimension/GeoZIP.xml"/>
191
192        </DIMENSIONS>
193
194
195</QUERY_MODULE>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.