source: main/adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19CntyTests.xml @ 20874

Last change on this file since 20874 was 20874, checked in by LoisHaggard_NM, 6 weeks ago

nm backend qModules 3.0 idepi covid positive test percentages

File size: 8.4 KB
Line 
1<?xml version="1.0" encoding="ISO-8859-1"?>
2
3<QUERY_MODULE xmlns:ibis="http://www.ibisph.org">
4
5        <NAME>COVID19</NAME>
6        <TITLE>New Mexico COVID-19 Data</TITLE>
7        <DESCRIPTION>Queries infectious disease data from NMEDSS.</DESCRIPTION>
8        <VERSION>Apr 5, 2020</VERSION>
9        <KEYWORDS>communicable disease, infectious disease, notifiable diseases, epidemiology, New Mexcio</KEYWORDS>
10        <ORG_UNIT_NAME>ID_EPI</ORG_UNIT_NAME>
11
12        <PARAMETERS>
13                <PARAMETER>
14                        <NAME>config</NAME>
15                        <VALUE>E:\ibisq\qModules30\idepi\_COVID19CntyTests.cfg</VALUE>
16                </PARAMETER>
17                <PARAMETER>
18                        <NAME>sas</NAME>
19                        <VALUE>0</VALUE>
20                </PARAMETER>
21                <PARAMETER>
22                        <NAME>test</NAME>
23                        <VALUE>0</VALUE>
24                </PARAMETER>
25        </PARAMETERS>
26
27        <QUERY_CONFIGURATION_SELECTION>
28                <LOCAL_URL>query/selection/idepi/_COVIDSelection.html</LOCAL_URL>
29                <TITLE>Infectious Disease Measures</TITLE>
30        </QUERY_CONFIGURATION_SELECTION>
31
32        <QUERY_APPLICATION_REQUEST_ADD_NON_FILTERED_GROUP_BY_DIMENSION_VALUES_FLAG/>
33        <QUERY_APPLICATION_HTTP_REQUEST_TYPE>post</QUERY_APPLICATION_HTTP_REQUEST_TYPE>
34
35        <CONFIGURATIONS>
36
37                <CONFIGURATION><NAME>Count</NAME>
38                        <TITLE>Number of Tests Conducted</TITLE>
39                        <DESCRIPTION>Number of tests</DESCRIPTION>
40                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
41                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
42                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
43                        <MEASURE_NAME>NumCases</MEASURE_NAME>
44                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Number of Tests</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
45                        <PARAMETERS>
46                                <PARAMETER>
47                                        <NAME>func</NAME>
48                                        <VALUE>NM_CountCOVID.def</VALUE>
49                                </PARAMETER>
50                        </PARAMETERS>
51                        <CRITERIA>
52                        </CRITERIA>
53                        <DATA_NOTES>
54                                <ibis:include href="data_note/COVID.xml"/>
55                        </DATA_NOTES>
56                        <DATA_SOURCES>
57                                <ibis:include href="data_source/NMEDSS.xml"/>
58                                <ibis:include href="data_source/GPS.xml"/>
59                        </DATA_SOURCES>
60                        <DATA_ISSUES>
61                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
62                        </DATA_ISSUES>
63                </CONFIGURATION>
64
65                <CONFIGURATION><NAME>PctPositive</NAME>
66                        <TITLE>Percentage of Tests that were Positive</TITLE>
67                        <DESCRIPTION>Number of cases</DESCRIPTION>
68                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
69                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelBluPur</DEFAULT_MAP_NAME>
70                        <MEASURE_NAME>PctDesirableLow</MEASURE_NAME>
71                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Test Positivity</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
72                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
73                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
74                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
75                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
76                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
77                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
78                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
79                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
80                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
81                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Number of Positive Tests</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
82                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
83                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
84                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
85                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Number of Positive and Negative Tests</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
86                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
87                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
88                        <PARAMETERS>
89                                <PARAMETER>
90                                        <NAME>func</NAME>
91                                        <VALUE>NM_PctDesirableLow.def</VALUE>
92                                </PARAMETER>
93                                <PARAMETER>
94                                        <NAME>spvar1</NAME>
95                                        <VALUE>_RESULT=1</VALUE>
96                                </PARAMETER>
97                                <PARAMETER>
98                                        <NAME>data_where</NAME>
99                                        <VALUE>detention=2</VALUE>
100                                </PARAMETER>
101                                <PARAMETER>
102                                        <NAME>TestResult</NAME>
103                                        <VALUE>1</VALUE>
104                                </PARAMETER>
105                                <PARAMETER>
106                                        <NAME>TestResult</NAME>
107                                        <VALUE>2</VALUE>
108                                </PARAMETER>
109                        </PARAMETERS>
110                        <CRITERIA>
111                        </CRITERIA>
112                        <DATA_NOTES>
113                                <ibis:include href="data_note/COVID.xml"/>
114                        </DATA_NOTES>
115                        <DATA_SOURCE_NAMES>
116                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
117                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
118                        </DATA_SOURCE_NAMES>
119                        <DATA_ISSUES>
120                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
121                        </DATA_ISSUES>
122                </CONFIGURATION>
123
124                <CONFIGURATION><NAME>PctPositiveRegion</NAME>
125                        <TITLE>Percentage of Tests that were Positive</TITLE>
126                        <DESCRIPTION>Number of cases</DESCRIPTION>
127                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
128                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelBluPur</DEFAULT_MAP_NAME>
129                        <MEASURE_NAME>PctDesirableLow</MEASURE_NAME>
130                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Test Positivity</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
131                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
132                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
133                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
134                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
135                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
136                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
137                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
138                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
139                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
140                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Number of Positive Tests</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
141                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
142                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
143                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
144                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Number of Positive and Negative Tests</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
145                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
146                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
147                        <PARAMETERS>
148                                <PARAMETER>
149                                        <NAME>func</NAME>
150                                        <VALUE>NM_PctDesirableLow.def</VALUE>
151                                </PARAMETER>
152                                <PARAMETER>
153                                        <NAME>spvar1</NAME>
154                                        <VALUE>_RESULT=1</VALUE>
155                                </PARAMETER>
156                                <PARAMETER>
157                                        <NAME>data_where</NAME>
158                                        <VALUE>detention=2</VALUE>
159                                </PARAMETER>
160                                <PARAMETER>
161                                        <NAME>TestResult</NAME>
162                                        <VALUE>1</VALUE>
163                                </PARAMETER>
164                                <PARAMETER>
165                                        <NAME>TestResult</NAME>
166                                        <VALUE>2</VALUE>
167                                </PARAMETER>
168                        </PARAMETERS>
169                        <CRITERIA>
170                        </CRITERIA>
171                        <DATA_NOTES>
172                                <ibis:include href="data_note/COVID.xml"/>
173                        </DATA_NOTES>
174                        <DATA_SOURCE_NAMES>
175                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
176                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
177                        </DATA_SOURCE_NAMES>
178                        <DATA_ISSUES>
179                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
180                        </DATA_ISSUES>
181                </CONFIGURATION>
182
183                <CONFIGURATION><NAME>TestedRate</NAME>
184                        <TITLE>Tests Conducted per 1,000 Population</TITLE>
185                        <DESCRIPTION>The number of tests * 1,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
186                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
187                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
188                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
189                        <MEASURE_NAME>RateCases1K</MEASURE_NAME>
190                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
191                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
192                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
193                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Tests</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
194                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
195                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
196                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
197                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
198                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
199                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
200                        <PARAMETERS>
201                                <PARAMETER>
202                                        <NAME>func</NAME>
203                                        <VALUE>NM_Rate1K.def</VALUE>
204                                </PARAMETER>
205                        </PARAMETERS>
206                        <CRITERIA>
207                        </CRITERIA>
208                        <DATA_NOTES>
209                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
210                        </DATA_NOTES>
211                        <DATA_SOURCE_NAMES>
212                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
213                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
214                        </DATA_SOURCE_NAMES>
215                        <DATA_ISSUES>
216                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
217                        </DATA_ISSUES>
218                </CONFIGURATION>
219
220        </CONFIGURATIONS>
221
222        <CRITERIA>
223                <OVERVIEWS>
224                        <ibis:include href="overview/NMEDSS.xml"/>
225                        <ibis:include href="overview/GettingStarted.xml"/>
226                </OVERVIEWS>
227                <SECTIONS>
228                        <ibis:include href="section/TestResult.xml" configuration-name-list="Count TestedRate"/>
229                        <ibis:include href="section/Period_COVIDTests.xml" configuration-name-list="Count TestedRate PctPositive PctPositiveRegion"/>
230                        <ibis:include href="section/Geo.xml" configuration-name-list="Count TestedRate PctPositive"/>
231                        <ibis:include href="section/GeoRegion.xml" configuration-name-list="PctPositiveRegion"/>
232                </SECTIONS>
233        </CRITERIA>
234
235        <DIMENSIONS>
236
237                <ibis:include href="dimension/TestResult.xml"/>
238                <ibis:include href="dimension/LastWeek.xml"/>
239
240                <ibis:include href="dimension/GeoProxy.xml"/>
241                <ibis:include href="dimension/GeoCnty.xml"/>
242                <ibis:include href="dimension/GeoState.xml"/>
243                <ibis:include href="dimension/GeoRegion.xml"/>
244                <ibis:include href="dimension/GeoUrbanRur.xml"/>
245                <ibis:include href="dimension/GeoZIP.xml"/>
246        </DIMENSIONS>
247
248
249</QUERY_MODULE>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.