source: main/adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19Cnty.xml @ 21047

Last change on this file since 21047 was 21047, checked in by LoisHaggard_NM, 2 months ago

nmibis-content query/idepi, COVID AA deaths and case fatality

File size: 12.2 KB
Line 
1<?xml version="1.0" encoding="ISO-8859-1"?>
2
3<QUERY_MODULE xmlns:ibis="http://www.ibisph.org">
4
5        <NAME>COVID19</NAME>
6        <TITLE>New Mexico COVID-19 Data</TITLE>
7        <DESCRIPTION>Queries infectious disease data from NMEDSS.</DESCRIPTION>
8        <VERSION>Jul 17, 2020</VERSION>
9        <KEYWORDS>communicable disease, infectious disease, notifiable diseases, epidemiology, New Mexcio</KEYWORDS>
10        <ORG_UNIT_NAME>ID_EPI</ORG_UNIT_NAME>
11
12        <PARAMETERS>
13                <PARAMETER>
14                        <NAME>config</NAME>
15                        <VALUE>E:\ibisq\qModules30\idepi\_COVID19Cnty.cfg</VALUE>
16                </PARAMETER>
17                <PARAMETER>
18                        <NAME>sas</NAME>
19                        <VALUE>0</VALUE>
20                </PARAMETER>
21                <PARAMETER>
22                        <NAME>test</NAME>
23                        <VALUE>0</VALUE>
24                </PARAMETER>
25        </PARAMETERS>
26
27        <QUERY_CONFIGURATION_SELECTION>
28                <LOCAL_URL>query/selection/idepi/_COVIDSelection.html</LOCAL_URL>
29                <TITLE>Infectious Disease Measures</TITLE>
30        </QUERY_CONFIGURATION_SELECTION>
31
32        <QUERY_APPLICATION_REQUEST_ADD_NON_FILTERED_GROUP_BY_DIMENSION_VALUES_FLAG/>
33        <QUERY_APPLICATION_HTTP_REQUEST_TYPE>post</QUERY_APPLICATION_HTTP_REQUEST_TYPE>
34
35        <CONFIGURATIONS>
36
37                <CONFIGURATION><NAME>Count</NAME>
38                        <TITLE>Number of Cases</TITLE>
39                        <DESCRIPTION>Number of cases</DESCRIPTION>
40                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
41                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
42                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
43                        <MEASURE_NAME>NumCases</MEASURE_NAME>
44                        <PARAMETERS>
45                                <PARAMETER>
46                                        <NAME>func</NAME>
47                                        <VALUE>NM_CountCOVID.def</VALUE>
48                                </PARAMETER>
49                        </PARAMETERS>
50                        <CRITERIA>
51                        </CRITERIA>
52                        <DATA_NOTES>
53                                <ibis:include href="data_note/COVID.xml"/>
54                        </DATA_NOTES>
55                        <DATA_SOURCE_NAMES>
56                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
57                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
58                        </DATA_SOURCE_NAMES>
59                        <DATA_ISSUES>
60                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
61                        </DATA_ISSUES>
62                </CONFIGURATION>
63
64                <CONFIGURATION><NAME>CrudeRateCases</NAME>
65                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
66                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
67                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
68                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
69                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
70                        <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME>
71                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
72                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
73                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
74                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
75                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
76                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
77                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
78                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
79                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
80                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
81                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
82                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
83                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
84                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
85                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
86                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
87                        <PARAMETERS>
88                                <PARAMETER>
89                                        <NAME>func</NAME>
90                                        <VALUE>NM_RateCrudeCOVID.def</VALUE>
91                                </PARAMETER>
92                        </PARAMETERS>
93                        <CRITERIA>
94                                <EXCLUDE>
95                                </EXCLUDE>
96                        </CRITERIA>
97                        <DATA_NOTES>
98                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
99                        </DATA_NOTES>
100                        <DATA_SOURCE_NAMES>
101                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
102                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
103                        </DATA_SOURCE_NAMES>
104                        <DATA_ISSUES>
105                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
106                        </DATA_ISSUES>
107                </CONFIGURATION>
108
109                <CONFIGURATION><NAME>CrudeRateDeaths</NAME>
110                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
111                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
112                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
113                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
114                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
115                        <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME>
116                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
117                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
118                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
119                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
120                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
121                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
122                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
123                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
124                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
125                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
126                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
127                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
128                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
129                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
130                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
131                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
132                        <PARAMETERS>
133                                <PARAMETER>
134                                        <NAME>func</NAME>
135                                        <VALUE>NM_RateCrudeCOVID.def</VALUE>
136                                </PARAMETER>
137                                <PARAMETER>
138                                        <NAME>CaseDisp4</NAME>
139                                        <VALUE>1</VALUE>
140                                </PARAMETER>
141                        </PARAMETERS>
142                        <CRITERIA>
143                                <EXCLUDE/>
144                        </CRITERIA>
145                        <DATA_NOTES>
146                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
147                        </DATA_NOTES>
148                        <DATA_SOURCE_NAMES>
149                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
150                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
151                        </DATA_SOURCE_NAMES>
152                        <DATA_ISSUES>
153                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
154                        </DATA_ISSUES>
155                </CONFIGURATION>
156
157                <CONFIGURATION><NAME>AgeRateDths</NAME>
158                        <TITLE>Deaths per 100,000 Population, Age-adjusted</TITLE>
159                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
160                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
161                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
162                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
163                        <MEASURE_NAME>RateAADths100K</MEASURE_NAME>
164                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
165                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
166                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
167                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
168                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
169                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
170                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
171                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
172                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
173                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Deaths</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
174                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
175                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
176                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
177                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
178                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
179                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
180                        <PARAMETERS>
181                                <PARAMETER>
182                                        <NAME>func</NAME>
183                                        <VALUE>NM_RateAADths100K.def</VALUE>
184                                </PARAMETER>
185                                <PARAMETER>
186                                        <NAME>CaseDisp4</NAME>
187                                        <VALUE>1</VALUE>
188                                </PARAMETER>
189                        </PARAMETERS>
190                        <CRITERIA>
191                                <EXCLUDE/>
192                        </CRITERIA>
193                        <DATA_NOTES>
194                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
195                        </DATA_NOTES>
196                        <DATA_SOURCE_NAMES>
197                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
198                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
199                        </DATA_SOURCE_NAMES>
200                        <DATA_ISSUES>
201                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
202                        </DATA_ISSUES>
203                </CONFIGURATION>
204 
205                <CONFIGURATION><NAME>CaseFatality</NAME>
206                        <TITLE>Percentage Distribution of Cases</TITLE>
207                        <DESCRIPTION>The percentage distribution of cases across dimension values.</DESCRIPTION>
208                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
209                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
210                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
211                        <MEASURE_NAME>PctDesirableLow</MEASURE_NAME>
212                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Percentage of COVID-19 Cases Resulting in Death</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
213                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
214                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
215                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
216                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
217                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
218                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
219                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
220                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
221                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
222                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
223                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
224                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
225                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
226                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
227                        <PARAMETERS>
228                                <PARAMETER>
229                                        <NAME>func</NAME>
230                                        <VALUE>NM_CaseFatalityCOVID.def</VALUE>
231                                </PARAMETER>
232                                <PARAMETER>
233                                        <NAME>spvar1</NAME>
234                                        <VALUE>disp4cat=1</VALUE>
235                                </PARAMETER>
236                        </PARAMETERS>
237                        <CRITERIA>
238                        </CRITERIA>
239                        <DATA_NOTES>
240                                <ibis:include href="data_note/COVID_AA.xml"/>
241                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
242                        </DATA_NOTES>
243                        <DATA_SOURCE_NAMES>
244                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
245                        </DATA_SOURCE_NAMES>
246                        <DATA_ISSUES>
247                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
248                        </DATA_ISSUES>
249                </CONFIGURATION>
250
251                <CONFIGURATION><NAME>PctDistribution</NAME>
252                        <TITLE>Percentage Distribution of Cases</TITLE>
253                        <DESCRIPTION>The percentage distribution of cases across dimension values.</DESCRIPTION>
254                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
255                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
256                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
257                        <MEASURE_NAME>Percentage</MEASURE_NAME>
258                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Percentage Distribution of Cases</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
259                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
260        <!--                    <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
261                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
262                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
263                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
264                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
265                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
266        -->                     <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
267                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
268                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
269                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
270                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
271                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
272                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
273                        <PARAMETERS>
274                                <PARAMETER>
275                                        <NAME>func</NAME>
276                                        <VALUE>NM_PctDistribution.def</VALUE>
277                                </PARAMETER>
278                        </PARAMETERS>
279                        <CRITERIA>
280                        </CRITERIA>
281                        <DATA_NOTES>
282                                <ibis:include href="data_note/PctDistribution.xml"/>
283                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
284                        </DATA_NOTES>
285                        <DATA_SOURCE_NAMES>
286                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
287                        </DATA_SOURCE_NAMES>
288                        <DATA_ISSUES>
289                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
290                        </DATA_ISSUES>
291                </CONFIGURATION>
292
293        </CONFIGURATIONS>
294
295        <CRITERIA>
296                <OVERVIEWS>
297                        <ibis:include href="overview/NMEDSS.xml"/>
298                        <ibis:include href="overview/GettingStarted.xml"/>
299                </OVERVIEWS>
300                <SECTIONS>
301                        <ibis:include href="section/CaseCharCOVID.xml"/>
302                        <ibis:include href="section/GeoCOVID.xml"/>
303                        <ibis:include href="section/PeriodCOVID.xml"/>
304                        <ibis:include href="section/AgeSexRaceCOVID.xml" configuration-name-list="Count, CrudeRate PctDistribution"/>
305                        <ibis:include href="section/SexRace.xml" configuration-name-list="AgeRate"/>
306                </SECTIONS>
307        </CRITERIA>
308
309        <DIMENSIONS>
310                <ibis:include href="dimension/GeoProxy.xml"/>
311                <ibis:include href="dimension/GeoCnty.xml"/>
312                <ibis:include href="dimension/GeoState.xml"/>
313                <ibis:include href="dimension/GeoRegion.xml"/>
314                <ibis:include href="dimension/GeoUrbanRur.xml"/>
315                <ibis:include href="dimension/GeoSarea.xml"/>
316
317                <ibis:include href="dimension/CaseDisp4.xml"/>
318                <ibis:include href="dimension/ReasonTested.xml"/>
319                <ibis:include href="dimension/LongTermCare.xml"/>
320                <ibis:include href="dimension/Detention.xml"/>
321
322                <ibis:include href="dimension/MMWR_WeekCOVID.xml"/>
323
324                <ibis:include href="dimension/AgeGrpProxy.xml"/>
325                <ibis:include href="dimension/AgeGrp4.xml"/>
326                <ibis:include href="dimension/AgeGrp5.xml"/>
327                <ibis:include href="dimension/AgeGrp7.xml"/>
328                <ibis:include href="dimension/AgeGrp8.xml"/>
329                <ibis:include href="dimension/AgeGrp9.xml"/>
330                <ibis:include href="dimension/AgeGrp11.xml"/>
331                <ibis:include href="dimension/AgeGrp13.xml"/>
332                <ibis:include href="dimension/AgeGrp18.xml"/>
333                <ibis:include href="dimension/AgeGrp35.xml"/>
334
335                <ibis:include href="dimension/Sex.xml"/>
336                <ibis:include href="dimension/RacEth.xml"/>
337        </DIMENSIONS>
338
339
340</QUERY_MODULE>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.