source: main/adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19Cnty.xml @ 21043

Last change on this file since 21043 was 21043, checked in by LoisHaggard_NM, 2 months ago

nmibis-content query/idepi, COVID deaths and hospitalizations

File size: 12.2 KB
Line 
1<?xml version="1.0" encoding="ISO-8859-1"?>
2
3<QUERY_MODULE xmlns:ibis="http://www.ibisph.org">
4
5        <NAME>COVID19</NAME>
6        <TITLE>New Mexico COVID-19 Data</TITLE>
7        <DESCRIPTION>Queries infectious disease data from NMEDSS.</DESCRIPTION>
8        <VERSION>Jul 17, 2020</VERSION>
9        <KEYWORDS>communicable disease, infectious disease, notifiable diseases, epidemiology, New Mexcio</KEYWORDS>
10        <ORG_UNIT_NAME>ID_EPI</ORG_UNIT_NAME>
11
12        <PARAMETERS>
13                <PARAMETER>
14                        <NAME>config</NAME>
15                        <VALUE>E:\ibisq\qModules30\idepi\_COVID19Cnty.cfg</VALUE>
16                </PARAMETER>
17                <PARAMETER>
18                        <NAME>sas</NAME>
19                        <VALUE>0</VALUE>
20                </PARAMETER>
21                <PARAMETER>
22                        <NAME>test</NAME>
23                        <VALUE>0</VALUE>
24                </PARAMETER>
25        </PARAMETERS>
26
27        <QUERY_CONFIGURATION_SELECTION>
28                <LOCAL_URL>query/selection/idepi/_COVIDSelection.html</LOCAL_URL>
29                <TITLE>Infectious Disease Measures</TITLE>
30        </QUERY_CONFIGURATION_SELECTION>
31
32        <QUERY_APPLICATION_REQUEST_ADD_NON_FILTERED_GROUP_BY_DIMENSION_VALUES_FLAG/>
33        <QUERY_APPLICATION_HTTP_REQUEST_TYPE>post</QUERY_APPLICATION_HTTP_REQUEST_TYPE>
34
35        <CONFIGURATIONS>
36
37                <CONFIGURATION><NAME>Count</NAME>
38                        <TITLE>Number of Cases</TITLE>
39                        <DESCRIPTION>Number of cases</DESCRIPTION>
40                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
41                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
42                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
43                        <MEASURE_NAME>NumCases</MEASURE_NAME>
44                        <PARAMETERS>
45                                <PARAMETER>
46                                        <NAME>func</NAME>
47                                        <VALUE>NM_CountCOVID.def</VALUE>
48                                </PARAMETER>
49                        </PARAMETERS>
50                        <CRITERIA>
51                        </CRITERIA>
52                        <DATA_NOTES>
53                                <ibis:include href="data_note/COVID.xml"/>
54                        </DATA_NOTES>
55                        <DATA_SOURCE_NAMES>
56                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
57                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
58                        </DATA_SOURCE_NAMES>
59                        <DATA_ISSUES>
60                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
61                        </DATA_ISSUES>
62                </CONFIGURATION>
63
64                <CONFIGURATION><NAME>CrudeRateCases</NAME>
65                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
66                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
67                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
68                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
69                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
70                        <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME>
71                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
72                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
73                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
74                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
75                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
76                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
77                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
78                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
79                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
80                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
81                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
82                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
83                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
84                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
85                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
86                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
87                        <PARAMETERS>
88                                <PARAMETER>
89                                        <NAME>func</NAME>
90                                        <VALUE>NM_RateCrudeCOVID.def</VALUE>
91                                </PARAMETER>
92                        </PARAMETERS>
93                        <CRITERIA>
94                                <EXCLUDE>
95                                </EXCLUDE>
96                        </CRITERIA>
97                        <DATA_NOTES>
98                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
99                        </DATA_NOTES>
100                        <DATA_SOURCE_NAMES>
101                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
102                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
103                        </DATA_SOURCE_NAMES>
104                        <DATA_ISSUES>
105                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
106                        </DATA_ISSUES>
107                </CONFIGURATION>
108
109                <CONFIGURATION><NAME>CrudeRateDths</NAME>
110                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
111                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
112                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
113                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
114                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
115                        <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME>
116                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
117                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
118                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
119                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
120                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
121                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
122                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
123                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
124                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
125                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
126                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
127                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
128                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
129                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
130                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
131                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
132                        <PARAMETERS>
133                                <PARAMETER>
134                                        <NAME>func</NAME>
135                                        <VALUE>NM_RateCrudeCOVID.def</VALUE>
136                                </PARAMETER>
137                        </PARAMETERS>
138                        <CRITERIA>
139                                <EXCLUDE/>
140                        </CRITERIA>
141                        <DATA_NOTES>
142                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
143                        </DATA_NOTES>
144                        <DATA_SOURCE_NAMES>
145                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
146                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
147                        </DATA_SOURCE_NAMES>
148                        <DATA_ISSUES>
149                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
150                        </DATA_ISSUES>
151                </CONFIGURATION>
152
153                <CONFIGURATION><NAME>AgeRateDths</NAME>
154                        <TITLE>Cases per 100,000 Population, Age-adjusted</TITLE>
155                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
156                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
157                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
158                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
159                        <MEASURE_NAME>RateAA100K</MEASURE_NAME> 
160                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Deaths per 100,000 Population, Age-adjusted</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
161                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
162                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
163                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
164                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
165                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
166                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
167                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
168                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
169                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
170                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
171                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
172                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
173                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
174                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
175                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
176                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
177                        <PARAMETERS>
178                                <PARAMETER>
179                                        <NAME>func</NAME>
180                                        <VALUE>NM_RateAA100K.def</VALUE>
181                                </PARAMETER>
182                                <PARAMETER>
183                                        <NAME>CaseDisp4</NAME>
184                                        <VALUE>1</VALUE>
185                                </PARAMETER>
186                        </PARAMETERS>
187                        <CRITERIA>
188                                <EXCLUDE/>
189                        </CRITERIA>
190                        <DATA_NOTES>
191                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
192                        </DATA_NOTES>
193                        <DATA_SOURCE_NAMES>
194                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
195                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
196                        </DATA_SOURCE_NAMES>
197                        <DATA_ISSUES>
198                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
199                        </DATA_ISSUES>
200                </CONFIGURATION>
201 
202                <CONFIGURATION><NAME>CaseFatality</NAME>
203                        <TITLE>Percentage Distribution of Cases</TITLE>
204                        <DESCRIPTION>The percentage distribution of cases across dimension values.</DESCRIPTION>
205                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
206                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
207                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
208                        <MEASURE_NAME>Percentage</MEASURE_NAME>
209                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Percentage of COVID-19 Cases Resulting in Death</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
210                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
211                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
212                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
213                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
214                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
215                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
216                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
217                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
218                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
219                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
220                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
221                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
222                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
223                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
224                        <PARAMETERS>
225                                <PARAMETER>
226                                        <NAME>func</NAME>
227                                        <VALUE>NM_CaseFatalityCOVID.def</VALUE>
228                                </PARAMETER>
229                                <PARAMETER>
230                                        <NAME>spvar1</NAME>
231                                        <VALUE>disp4cat=1</VALUE>
232                                </PARAMETER>
233                        </PARAMETERS>
234                        <CRITERIA>
235                        </CRITERIA>
236                        <DATA_NOTES>
237                                <ibis:include href="data_note/COVID_AA.xml"/>
238                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
239                        </DATA_NOTES>
240                        <DATA_SOURCE_NAMES>
241                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
242                        </DATA_SOURCE_NAMES>
243                        <DATA_ISSUES>
244                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
245                        </DATA_ISSUES>
246                </CONFIGURATION>
247
248                <CONFIGURATION><NAME>PctDistribution</NAME>
249                        <TITLE>Percentage Distribution of Cases</TITLE>
250                        <DESCRIPTION>The percentage distribution of cases across dimension values.</DESCRIPTION>
251                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
252                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
253                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
254                        <MEASURE_NAME>Percentage</MEASURE_NAME>
255                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Percentage Distribution of Cases</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
256                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
257        <!--                    <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
258                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
259                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
260                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
261                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
262                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
263        -->                     <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
264                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
265                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
266                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
267                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
268                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
269                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
270                        <PARAMETERS>
271                                <PARAMETER>
272                                        <NAME>func</NAME>
273                                        <VALUE>NM_PctDistribution.def</VALUE>
274                                </PARAMETER>
275                        </PARAMETERS>
276                        <CRITERIA>
277                        </CRITERIA>
278                        <DATA_NOTES>
279                                <ibis:include href="data_note/PctDistribution.xml"/>
280                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
281                        </DATA_NOTES>
282                        <DATA_SOURCE_NAMES>
283                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
284                        </DATA_SOURCE_NAMES>
285                        <DATA_ISSUES>
286                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
287                        </DATA_ISSUES>
288                </CONFIGURATION>
289
290        </CONFIGURATIONS>
291
292        <CRITERIA>
293                <OVERVIEWS>
294                        <ibis:include href="overview/NMEDSS.xml"/>
295                        <ibis:include href="overview/GettingStarted.xml"/>
296                </OVERVIEWS>
297                <SECTIONS>
298                        <ibis:include href="section/CaseCharCOVID.xml"/>
299                        <ibis:include href="section/GeoCOVID.xml"/>
300                        <ibis:include href="section/PeriodCOVID.xml"/>
301                        <ibis:include href="section/AgeSexRaceCOVID.xml" configuration-name-list="Count, CrudeRate PctDistribution"/>
302                        <ibis:include href="section/SexRace.xml" configuration-name-list="AgeRate"/>
303                </SECTIONS>
304        </CRITERIA>
305
306        <DIMENSIONS>
307                <ibis:include href="dimension/GeoProxy.xml"/>
308                <ibis:include href="dimension/GeoCnty.xml"/>
309                <ibis:include href="dimension/GeoState.xml"/>
310                <ibis:include href="dimension/GeoRegion.xml"/>
311                <ibis:include href="dimension/GeoUrbanRur.xml"/>
312                <ibis:include href="dimension/GeoSarea.xml"/>
313
314                <ibis:include href="dimension/CaseDisp4.xml"/>
315                <ibis:include href="dimension/ReasonTested.xml"/>
316                <ibis:include href="dimension/LongTermCare.xml"/>
317                <ibis:include href="dimension/Detention.xml"/>
318
319                <ibis:include href="dimension/MMWR_WeekCOVID.xml"/>
320
321                <ibis:include href="dimension/AgeGrpProxy.xml"/>
322                <ibis:include href="dimension/AgeGrp4.xml"/>
323                <ibis:include href="dimension/AgeGrp5.xml"/>
324                <ibis:include href="dimension/AgeGrp7.xml"/>
325                <ibis:include href="dimension/AgeGrp8.xml"/>
326                <ibis:include href="dimension/AgeGrp9.xml"/>
327                <ibis:include href="dimension/AgeGrp11.xml"/>
328                <ibis:include href="dimension/AgeGrp13.xml"/>
329                <ibis:include href="dimension/AgeGrp18.xml"/>
330                <ibis:include href="dimension/AgeGrp35.xml"/>
331
332                <ibis:include href="dimension/Sex.xml"/>
333                <ibis:include href="dimension/RacEth.xml"/>
334        </DIMENSIONS>
335
336
337</QUERY_MODULE>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.