source: main/adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19Cnty.xml @ 21016

Last change on this file since 21016 was 21016, checked in by LoisHaggard_NM, 2 months ago

nmibis-content query/idepi updates for age-adjusted deaths

File size: 9.2 KB
Line 
1<?xml version="1.0" encoding="ISO-8859-1"?>
2
3<QUERY_MODULE xmlns:ibis="http://www.ibisph.org">
4
5        <NAME>COVID19</NAME>
6        <TITLE>New Mexico COVID-19 Data</TITLE>
7        <DESCRIPTION>Queries infectious disease data from NMEDSS.</DESCRIPTION>
8        <VERSION>Jul 10, 2020</VERSION>
9        <KEYWORDS>communicable disease, infectious disease, notifiable diseases, epidemiology, New Mexcio</KEYWORDS>
10        <ORG_UNIT_NAME>ID_EPI</ORG_UNIT_NAME>
11
12        <PARAMETERS>
13                <PARAMETER>
14                        <NAME>config</NAME>
15                        <VALUE>E:\ibisq\qModules30\idepi\_COVID19Cnty.cfg</VALUE>
16                </PARAMETER>
17                <PARAMETER>
18                        <NAME>sas</NAME>
19                        <VALUE>0</VALUE>
20                </PARAMETER>
21                <PARAMETER>
22                        <NAME>test</NAME>
23                        <VALUE>0</VALUE>
24                </PARAMETER>
25        </PARAMETERS>
26
27        <QUERY_CONFIGURATION_SELECTION>
28                <LOCAL_URL>query/selection/idepi/_COVIDSelection.html</LOCAL_URL>
29                <TITLE>Infectious Disease Measures</TITLE>
30        </QUERY_CONFIGURATION_SELECTION>
31
32        <QUERY_APPLICATION_REQUEST_ADD_NON_FILTERED_GROUP_BY_DIMENSION_VALUES_FLAG/>
33        <QUERY_APPLICATION_HTTP_REQUEST_TYPE>post</QUERY_APPLICATION_HTTP_REQUEST_TYPE>
34
35        <CONFIGURATIONS>
36
37                <CONFIGURATION><NAME>Count</NAME>
38                        <TITLE>Number of Cases</TITLE>
39                        <DESCRIPTION>Number of cases</DESCRIPTION>
40                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
41                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
42                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
43                        <MEASURE_NAME>NumCases</MEASURE_NAME>
44                        <PARAMETERS>
45                                <PARAMETER>
46                                        <NAME>func</NAME>
47                                        <VALUE>NM_CountCOVID.def</VALUE>
48                                </PARAMETER>
49                        </PARAMETERS>
50                        <CRITERIA>
51                        </CRITERIA>
52                        <DATA_NOTES>
53                                <ibis:include href="data_note/COVID.xml"/>
54                        </DATA_NOTES>
55                        <DATA_SOURCE_NAMES>
56                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
57                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
58                        </DATA_SOURCE_NAMES>
59                        <DATA_ISSUES>
60                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
61                        </DATA_ISSUES>
62                </CONFIGURATION>
63
64                <CONFIGURATION><NAME>CrudeRate</NAME>
65                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
66                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
67                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
68                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
69                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
70                        <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME>
71                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
72                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
73                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
74                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
75                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
76                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
77                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
78                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
79                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
80                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
81                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
82                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
83                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
84                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
85                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
86                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
87                        <PARAMETERS>
88                                <PARAMETER>
89                                        <NAME>func</NAME>
90                                        <VALUE>NM_RateCrudeCOVID.def</VALUE>
91                                </PARAMETER>
92                        </PARAMETERS>
93                        <CRITERIA>
94                                <EXCLUDE>
95                                        <SELECTIONS>
96                                                <SELECTION>
97                                                        <NAME>SpecialPop_exclude</NAME>
98                                                        <VALUE>all</VALUE>
99                                                </SELECTION>
100                                        </SELECTIONS>
101                                </EXCLUDE>
102                        </CRITERIA>
103                        <DATA_NOTES>
104                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
105                                <ibis:include href="data_note/COVID_AA.xml"/>
106                        </DATA_NOTES>
107                        <DATA_SOURCE_NAMES>
108                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
109                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
110                        </DATA_SOURCE_NAMES>
111                        <DATA_ISSUES>
112                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
113                        </DATA_ISSUES>
114                </CONFIGURATION>
115
116                <CONFIGURATION><NAME>AgeRate</NAME>
117                        <TITLE>Cases per 100,000 Population, Age-adjusted</TITLE>
118                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
119                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
120                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
121                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
122                        <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME> <!--Use this measure so I can have a special data note for covid AA-->
123                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Cases per 100,000 Population, Age-adjusted</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
124                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
125                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
126                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
127                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
128                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
129                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
130                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
131                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
132                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
133                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
134                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
135                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
136                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
137                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
138                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
139                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
140                        <PARAMETERS>
141                                <PARAMETER>
142                                        <NAME>func</NAME>
143                                        <VALUE>NM_RateAA100KCOVID.def</VALUE>
144                                </PARAMETER>
145                        </PARAMETERS>
146                        <CRITERIA>
147                                <EXCLUDE>
148                                        <SELECTIONS>
149                                                <SELECTION>
150                                                        <NAME>SpecialPop_exclude</NAME>
151                                                        <VALUE>all</VALUE>
152                                                </SELECTION>
153                                        </SELECTIONS>
154                                </EXCLUDE>
155                        </CRITERIA>
156                        <DATA_NOTES>
157                                <ibis:include href="data_note/COVID_AA.xml"/>
158                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
159                        </DATA_NOTES>
160                        <DATA_SOURCE_NAMES>
161                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
162                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
163                        </DATA_SOURCE_NAMES>
164                        <DATA_ISSUES>
165                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
166                        </DATA_ISSUES>
167                </CONFIGURATION>
168
169                <CONFIGURATION><NAME>PctDistribution</NAME>
170                        <TITLE>Percentage Distribution of Cases</TITLE>
171                        <DESCRIPTION>The percentage distribution of cases across dimension values.</DESCRIPTION>
172                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
173                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
174                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
175                        <MEASURE_NAME>Percentage</MEASURE_NAME>
176                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Percentage Distribution of Cases</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
177                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
178        <!--                    <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
179                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
180                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
181                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
182                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
183                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
184        -->                     <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
185                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
186                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
187                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
188                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
189                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
190                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
191                        <PARAMETERS>
192                                <PARAMETER>
193                                        <NAME>func</NAME>
194                                        <VALUE>NM_PctDistribution.def</VALUE>
195                                </PARAMETER>
196                        </PARAMETERS>
197                        <CRITERIA>
198                        </CRITERIA>
199                        <DATA_NOTES>
200                                <ibis:include href="data_note/PctDistribution.xml"/>
201                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
202                        </DATA_NOTES>
203                        <DATA_SOURCE_NAMES>
204                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
205                        </DATA_SOURCE_NAMES>
206                        <DATA_ISSUES>
207                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
208                        </DATA_ISSUES>
209                </CONFIGURATION>
210
211        </CONFIGURATIONS>
212
213        <CRITERIA>
214                <OVERVIEWS>
215                        <ibis:include href="overview/NMEDSS.xml"/>
216                        <ibis:include href="overview/GettingStarted.xml"/>
217                </OVERVIEWS>
218                <SECTIONS>
219                        <ibis:include href="section/CaseCharCOVID.xml"/>
220                        <ibis:include href="section/GeoCOVID.xml"/>
221                        <ibis:include href="section/PeriodCOVID.xml"/>
222                        <ibis:include href="section/AgeSexRaceCOVID.xml" configuration-name-list="Count, CrudeRate PctDistribution"/>
223                        <ibis:include href="section/SexRace.xml" configuration-name-list="AgeRate"/>
224                </SECTIONS>
225        </CRITERIA>
226
227        <DIMENSIONS>
228                <ibis:include href="dimension/GeoProxy.xml"/>
229                <ibis:include href="dimension/GeoCnty.xml"/>
230                <ibis:include href="dimension/GeoState.xml"/>
231                <ibis:include href="dimension/GeoRegion.xml"/>
232                <ibis:include href="dimension/GeoUrbanRur.xml"/>
233                <ibis:include href="dimension/GeoSarea.xml"/>
234
235                <ibis:include href="dimension/CaseDisp4.xml"/>
236                <ibis:include href="dimension/ReasonTested.xml"/>
237                <ibis:include href="dimension/SpecialPop.xml" configuration-name-list="Count, PctDistribution"/>
238
239                <ibis:include href="dimension/MMWR_WeekCOVID.xml"/>
240
241                <ibis:include href="dimension/AgeGrpProxy.xml"/>
242                <ibis:include href="dimension/AgeGrp4.xml"/>
243                <ibis:include href="dimension/AgeGrp5.xml"/>
244                <ibis:include href="dimension/AgeGrp7.xml"/>
245                <ibis:include href="dimension/AgeGrp8.xml"/>
246                <ibis:include href="dimension/AgeGrp9.xml"/>
247                <ibis:include href="dimension/AgeGrp11.xml"/>
248                <ibis:include href="dimension/AgeGrp13.xml"/>
249                <ibis:include href="dimension/AgeGrp18.xml"/>
250                <ibis:include href="dimension/AgeGrp35.xml"/>
251
252                <ibis:include href="dimension/Sex.xml"/>
253                <ibis:include href="dimension/RacEth.xml"/>
254        </DIMENSIONS>
255
256
257</QUERY_MODULE>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.