source: main/adopters/nm/trunk/src/main/webapps/nmibis-content/xml/query/module/idepi/COVID19Cnty.xml @ 21015

Last change on this file since 21015 was 21015, checked in by LoisHaggard_NM, 2 months ago

nmibis-content query/idepi updates for new variables, outcome, reason tested, special populations

File size: 6.9 KB
Line 
1<?xml version="1.0" encoding="ISO-8859-1"?>
2
3<QUERY_MODULE xmlns:ibis="http://www.ibisph.org">
4
5        <NAME>COVID19</NAME>
6        <TITLE>New Mexico COVID-19 Data</TITLE>
7        <DESCRIPTION>Queries infectious disease data from NMEDSS.</DESCRIPTION>
8        <VERSION>Jul 10, 2020</VERSION>
9        <KEYWORDS>communicable disease, infectious disease, notifiable diseases, epidemiology, New Mexcio</KEYWORDS>
10        <ORG_UNIT_NAME>ID_EPI</ORG_UNIT_NAME>
11
12        <PARAMETERS>
13                <PARAMETER>
14                        <NAME>config</NAME>
15                        <VALUE>E:\ibisq\qModules30\idepi\_COVID19Cnty.cfg</VALUE>
16                </PARAMETER>
17                <PARAMETER>
18                        <NAME>sas</NAME>
19                        <VALUE>0</VALUE>
20                </PARAMETER>
21                <PARAMETER>
22                        <NAME>test</NAME>
23                        <VALUE>0</VALUE>
24                </PARAMETER>
25        </PARAMETERS>
26
27        <QUERY_CONFIGURATION_SELECTION>
28                <LOCAL_URL>query/selection/idepi/_COVIDSelection.html</LOCAL_URL>
29                <TITLE>Infectious Disease Measures</TITLE>
30        </QUERY_CONFIGURATION_SELECTION>
31
32        <QUERY_APPLICATION_REQUEST_ADD_NON_FILTERED_GROUP_BY_DIMENSION_VALUES_FLAG/>
33        <QUERY_APPLICATION_HTTP_REQUEST_TYPE>post</QUERY_APPLICATION_HTTP_REQUEST_TYPE>
34
35        <CONFIGURATIONS>
36
37                <CONFIGURATION><NAME>Count</NAME>
38                        <TITLE>Number of Cases</TITLE>
39                        <DESCRIPTION>Number of cases</DESCRIPTION>
40                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
41                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
42                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
43                        <MEASURE_NAME>NumCases</MEASURE_NAME>
44                        <PARAMETERS>
45                                <PARAMETER>
46                                        <NAME>func</NAME>
47                                        <VALUE>NM_CountCOVID.def</VALUE>
48                                </PARAMETER>
49                        </PARAMETERS>
50                        <CRITERIA>
51                        </CRITERIA>
52                        <DATA_NOTES>
53                                <ibis:include href="data_note/COVID.xml"/>
54                        </DATA_NOTES>
55                        <DATA_SOURCE_NAMES>
56                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
57                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
58                        </DATA_SOURCE_NAMES>
59                        <DATA_ISSUES>
60                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
61                        </DATA_ISSUES>
62                </CONFIGURATION>
63
64                <CONFIGURATION><NAME>CrudeRate</NAME>
65                        <TITLE>Cases per 100,000 Population (Crude Rate)</TITLE>
66                        <DESCRIPTION>The number of cases * 100,000, divided by the population estimate over the time period.</DESCRIPTION>
67                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
68                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
69                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
70                        <MEASURE_NAME>RateCases100K</MEASURE_NAME>
71                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
72                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
73                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
74                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
75                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
76                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
77                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
78                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
79                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
80                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>COVID-19 Cases</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
81                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
82                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
83                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
84                                        <ANCILLARY_VALUE_LABEL>Population Estimate</ANCILLARY_VALUE_LABEL>
85                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
86                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
87                        <PARAMETERS>
88                                <PARAMETER>
89                                        <NAME>func</NAME>
90                                        <VALUE>NM_RateCrudeCOVID.def</VALUE>
91                                </PARAMETER>
92                        </PARAMETERS>
93                        <CRITERIA>
94                                <EXCLUDE>
95                                        <SELECTIONS>
96                                                <SELECTION>
97                                                        <NAME>SpecialPop_exclude</NAME>
98                                                        <VALUE>all</VALUE>
99                                                </SELECTION>
100                                        </SELECTIONS>
101                                </EXCLUDE>
102                        </CRITERIA>
103                        <DATA_NOTES>
104                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
105                        </DATA_NOTES>
106                        <DATA_SOURCE_NAMES>
107                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
108                                <DATA_SOURCE_NAME>GPS_PopEst</DATA_SOURCE_NAME>
109                        </DATA_SOURCE_NAMES>
110                        <DATA_ISSUES>
111                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
112                        </DATA_ISSUES>
113                </CONFIGURATION>
114
115                <CONFIGURATION><NAME>PctDistribution</NAME>
116                        <TITLE>Percentage Distribution of Cases</TITLE>
117                        <DESCRIPTION>The percentage distribution of cases across dimension values.</DESCRIPTION>
118                        <DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>GeoProxy</DEFAULT_CATEGORY_DIMENSION_NAME>
119                        <DEFAULT_MAP_NAME>DEFAULT_YelOrRed</DEFAULT_MAP_NAME>
120                        <DEFAULT_CHART_NAME>GroupedBarCOVID</DEFAULT_CHART_NAME>
121                        <MEASURE_NAME>Percentage</MEASURE_NAME>
122                        <MEASURE_TITLE_OVERRIDE>Percentage Distribution of Cases</MEASURE_TITLE_OVERRIDE>
123                        <DATASET_ANCILLARY_VALUES>
124        <!--                    <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
125                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>LowerConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
126                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
127                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
128                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>UpperConfidenceLimit</ANCILLARY_VALUE_NAME>
129                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
130        -->                     <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
131                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Numerator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
132                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
133                                <DATASET_ANCILLARY_VALUE>
134                                        <ANCILLARY_VALUE_NAME>Denominator</ANCILLARY_VALUE_NAME>
135                                </DATASET_ANCILLARY_VALUE>
136                        </DATASET_ANCILLARY_VALUES>
137                        <PARAMETERS>
138                                <PARAMETER>
139                                        <NAME>func</NAME>
140                                        <VALUE>NM_PctDistribution.def</VALUE>
141                                </PARAMETER>
142                        </PARAMETERS>
143                        <CRITERIA>
144                        </CRITERIA>
145                        <DATA_NOTES>
146                                <ibis:include href="data_note/PctDistribution.xml"/>
147                                <ibis:include href="data_note/NoDetention.xml"/>
148                                <ibis:include href="data_note/IDEpiAll.xml"/>
149                        </DATA_NOTES>
150                        <DATA_SOURCE_NAMES>
151                                <DATA_SOURCE_NAME>NMEDSS</DATA_SOURCE_NAME>
152                        </DATA_SOURCE_NAMES>
153                        <DATA_ISSUES>
154                                <ibis:include href="data_issue/IDEpiNotify.xml"/>
155                        </DATA_ISSUES>
156                </CONFIGURATION>
157
158        </CONFIGURATIONS>
159
160        <CRITERIA>
161                <OVERVIEWS>
162                        <ibis:include href="overview/NMEDSS.xml"/>
163                        <ibis:include href="overview/GettingStarted.xml"/>
164                </OVERVIEWS>
165                <SECTIONS>
166                        <ibis:include href="section/CaseCharCOVID.xml"/>
167                        <ibis:include href="section/GeoCOVID.xml"/>
168                        <ibis:include href="section/Period_COVID.xml"/>
169                        <ibis:include href="section/AgeSexRace.xml"/>
170                </SECTIONS>
171        </CRITERIA>
172
173        <DIMENSIONS>
174                <ibis:include href="dimension/GeoProxy.xml"/>
175                <ibis:include href="dimension/GeoCnty.xml"/>
176                <ibis:include href="dimension/GeoState.xml"/>
177                <ibis:include href="dimension/GeoRegion.xml"/>
178                <ibis:include href="dimension/GeoUrbanRur.xml"/>
179                <ibis:include href="dimension/GeoSarea.xml"/>
180
181                <ibis:include href="dimension/CaseDisp4.xml"/>
182                <ibis:include href="dimension/ReasonTested.xml"/>
183                <ibis:include href="dimension/SpecialPop.xml" configuration-name-list="Count, PctDistribution"/>
184
185                <ibis:include href="dimension/MMWR_WeekCOVID.xml"/>
186
187                <ibis:include href="dimension/AgeGrpProxy.xml"/>
188                <ibis:include href="dimension/AgeGrp4.xml"/>
189                <ibis:include href="dimension/AgeGrp7.xml"/>
190                <ibis:include href="dimension/AgeGrp8.xml"/>
191                <ibis:include href="dimension/AgeGrp9.xml"/>
192                <ibis:include href="dimension/AgeGrp11.xml"/>
193                <ibis:include href="dimension/AgeGrp13.xml"/>
194                <ibis:include href="dimension/AgeGrp18.xml"/>
195                <ibis:include href="dimension/AgeGrp35.xml"/>
196
197                <ibis:include href="dimension/Sex.xml"/>
198                <ibis:include href="dimension/RacEth.xml"/>
199        </DIMENSIONS>
200
201
202</QUERY_MODULE>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.